Basic Information

Symbol
hsa_CHD7_0008100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CHD7_0066
Host gene
CHD7
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
8:61713496-61714152 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:60800937-60801593 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-147.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -161.60 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 209.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((..(((((((((..(........)..)).)))))))))).)((((.....((((((.((((.(((((..((((........))))..)))))........(((((((((.......)))))))))...(((((((....))))))).....((((.(((..((((((...((..(((((((((....))))))))))).))))))..)))..))))(((((..((((((((((...(((...(((((...)))))...)))..(((((......)))))..((((......))))..))))))))))..)))))((((((..............)))))).....(((((......))))).....))))..))))))...(((((..........((((.(((((((..((((((......)))))).))))))).))))........)))))....((((((.............))))))...((((((((((...((.(...((((..((((.(((.(((((.(((((.....)))))))))).))))))).))))...).))...))))))))))..........(((((....)))))..(((....)))...........(((((....)))))........))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,(({..,{{||{((({{({{.,,{{..,,||,|}||}},}}}.}{{|{.....{{{{((,{{{{,(((((..((((........))))..))))}....,,,.(((((((((.......)))))))))}},(((((((....))))))).....((((.(((..((((((...{(..(((((((((....)))))))))}},))))))..)))..)))),((((..((((((((((...,{{...(((((...)))))...}},..,{{,{,,....}))})..((((......))))..))))))))))..))))|((((((..........,...)))))),...,(((((......))))).,...},,,..))}}}}.,,|||,,,,,.|||,..,|||,||{((((((((((((,..,{{{{,(((.((|(|..{((,,.....}}|,,||,}}.}})))}))...((((,({{({,.{..,......}}}}}}},)}})},,)})))))))),.}},.}||||}|||||,.}},}}))),))}}|,|||{||{|{|{{,||..|||||||||||,{{,,,,,||}..{{{{{...,)))}},,||}},..}))}}}}},..,,,{((((....))))),,,.....))))
Forensic Context

No forensic context available.