Basic Information
Symbol
hsa_CHD7_0010700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CHD7_0131
Host gene
CHD7
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:61732566-61754611
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:60820007-60842052
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-657.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-697.91 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
595.28
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((.....))))))))((((.(((((((((((((.(........).)))))).))))))))........((((.....((((.((.(((.((((.((.(((((((.....))))))...........).)).))))))))).)))).((((((((.((((((............))))))....)).))))))......))))...((..(((((((((((..(((((((((.((..(((..((((((.(((....(((((((((...........................(((((((((((((((((......))).))))))))))))))......(((((((((..((((((((((((.(((((..(((((........))))).)))))..(((((.....)))))..........((((((...(((((((((((......((((((((((.......((((.....)))).((((((...((((((((..(((((((...((((((.....))))))((((.....((.((((..((((.(.(((((((((((((....((((....((((((....(((....)))...))))))....))))))))))).((((((.(.......).))))))...)))))).)))))..(((((((((....))).....(((.((((((..(((....((((....))))......)))..)))))))))..(((((((((((((((..(((((.(((((..((((..((.(((..(..(((...))).)..))).))..))))((((....))))(((((((((((((((((((..((((((((((((.(((((((.((((.((((......)))).))))..))).......)))).).)))))....(((.(((.(((.......)))...))).)))...((((((......))))))........))))))..))..))))))..........))))).))))))........(((....)))......))))))))))))))))..............))))))))).(((((.(((.................................((((((((((((.....)))))))..))))).((((.(((((((.((((((((......((((((.((.(((.................))).))))))))))))))))(((((...(((.(((((((...(((((((((.((........)).))))..)))))...(((..((((...)))).)))(((((((((((......)))))).))))))))))))))).)))))....((((((.......)).)))).)))).))))))).......(((........))).))).)))))..))))))..))))))...))))......))))))).)))))))).))))))...((((.((..(((((((((((........)))))).)))))..))))))..((((..(((((.((((((((((.................((((((((((((((((.((((...(((((..(((((.....)))))...((((........))))........(((((......))))).)))))))))...)))))......)))))))))))...(((...))).)))))..))))).)))))....))))...))))))))))......(((((...)))))...(((((....))))).))))))))))).((((((......(.((((((((((((....((((....((((....))))......))))..)))))))).)))).).....))))))..((.((......)).))....)))))).)))))))))))).)))))))))...(((((.........)))))..)))))))))...)))..))))))..)))..)).)))....((((((.(((.....))).).)))))....))))))......((((((.((..(((((...)))))...))...)))))))))))))).)))..)).....((((((((.(((....(((((...(((((((....(((((.......((((((((((....((..((....))..))....).)))))))))......))))).....)))))))...)))))..))).)))))))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((.....))))))))(((..{((((((((((({.,,{,.....),)))))).))))))}|...,.,,,((((,....((((.((.(((.(({(,{{,,({{(((,,..|)}}}}},....,..,,}},}},}))))))}).)})).((((({,(,(({{{{...,,,,.....||||}}....}|,||||||,,....||}}...{{..(((((((((((..{{(((({((,((..(((..{{{{{{.(((..{{((({{{((({.................,,,..},,.(((((((((((((((((......))).))))))))))))))...,,,(({{{{((({.,{{{{{{{((((.((((({.{((((........))))},))))).,|||{({{...)))},.....,....{|,,,{|{{(((((((((((.{{...((((((((((,,,,,..{{((,....)))}.,((({(,,,(({{{(((,,((((({({..((((((.....))))))((((....,({.((((.,((({.{.(((((((((((((,...{(({....((,((({...(((....)))...)))))).,..))))))))))).((((((.,.......).)))))}...)))))).})))).,{((((((((....))).||{{({{.((((((..(((.{..((((....))))......)))..))))))}||,.{((((((((((((((..(((((.(((((..((((..(({(((..(..(((...))).,..))).,),,))))((((....))))(((((((((((((((((((..(((((((,,(((,{((,(((.((((.((((......)))).))))..)))......{|||,{(({(((......}))}...}||.}}}}...,|,..,,,.}|||,,{{{{||,.....)))})).}}}..).})))))..,)},}}))))..........)))))},)))))........{{{....)},......))))))))))))))))..............))))))))}.|||(({(((,..,,....||.......{,,{,,.......,}||||,{((((((.....))))))),.}}}||{((,,.,,,,,||}||{{{{{{,,,,,,(((((,,((.(((..............,..))).)))))))))))))}}}(((((...(((.(((((((.,,(((((((((.((........)).)))),,)))))...(((..((((...)))).))){((((((((((......)))))),))))})))))))))).))))).,,,||||{{.......}},}}}},||,,.,,,,,)).,}}.,.{{{........))).})),))))),.))))))..})))}).,,}}}|,..,,|}}}}}}}.)))))))).,}}})},,,({((,{{..(((((((((((........)))))).)))))..))}))),.({((|,{{{{|,{|{|||{{((|,,,.,}|.........(((((((((((,,(((((.(((((((.,.........}...))))))}..})))){{({(({.,.....(({.(((((......)))))...))).......,)))))}}...)))))))))))...{(({{,,,,,))))},.,}})),))}}}....,}})...))))))))))......(((((...)))))...{((({....})))).))))))))))).||||{{...,..,.((((((((((((....((((....((((....))))......))))..)))))))).)))),|,,,..}}||}}..||.....}},,}..))}...}))))},)))}})))}}}},||}}||||},,,(((((,,,,,,...}}}})}}))))}})))),.}})..)}}})),,))).,)),))),...{{|{||.{{|,,,,.))).}.))))}....)))))).....|{((((|.|{..{{(((,..|}}|}||,.....}}})}})|||||||,|}}..},.....{{{|{{||,|{|,,,,|||||,..|||{{{,.,{.(((((...,...((((((((((...,((..((,,,,|}..)),,..).))))))))).,.,..)))))...,.))))))).,,))))}..})).)))))))).)))
Forensic Context
No forensic context available.