Basic Information

Symbol
hsa_CHD7_0011500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CHD7_0133
Host gene
CHD7
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:61736399-61757968 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:60823840-60845409 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-601.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -636.78 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 390.40
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((((....((((.......(((((.((..((((((.(.......).)))))).....(((.((.(((((.((((.(((....))).)))).(((((...(((....)))....)))))......(((((((..(((...((.(((((.(((.((((((..(((((.(((((..((((..((.(((..(..(((...))).)..))).))..))))((((....))))(((((((((((((((((((..((((((((((((.(((((((.((((.((((......)))).))))..))).......)))).).)))))....(((.(((.(((.......)))...))).)))...((((((......))))))........))))))..))..))))))..........))))).))))))........(((....)))......)))))))))))))))).....((((((.(((((((((....(((..(((...)))..))).(((..(((.............((((((((((((.....)))))))..)))))..........(((.((((((((......((((((.((.(((.................))).)))))))))))))))).)))((((......((((..(((((((((((...((((........(((((((((.........))).))))))....(((((...(((...((((((((((.(((((((((((.((((.(((.....((((((.......)).)))).)))))))...(((......(((........)))....))).))))))))).(((....)))....((((((((.......))))))))..(((((((((((((((..(((((((((((........)))))).)))))..)).)))(((.((((....)))).)))..((((((((((....((((.((((((((((((((((.((((...(((((..(((((.....)))))...((((........))))........(((((......))))).)))))))))...)))))......))))))))))).((((((((..(((..(((((..((((...........))))..))))))))..))))))))...............(((..(((((......))))))))((((((......(.((((((((((((....((((....((((....))))......))))..)))))))).)))).).....)))))).........))))...)))...)))))))..((((((...(((((.((((...((((((((((((.......)))))))..)))))...))))...)))))...)))))).....((((((.(((.....))).).)))))..))))))))))...(((((((.((..(((((...)))))...))...)))))))....((((((((....((((......((.(((((..((((((..((((...(((((.(((((((....(((((.((((.((((..(((((((...))))..)))....)))).))))))).)).....)))))))((((.((((((..((.((((((((.(((...))).)))))))).)))))))).))))((.((.......))))...)))))...)))).)).)))).))))).)).......))))..)))))))).....(((((........)))))...........)).))))))))))...)))..))))).))))((.(((((((.........))))))).)).....))))))))))).))))))))..)))..)))...))))))))))))))).)))........((((((((.(.(((...)))).)))))))).))))).))....)))....)))))))))))).)))))...)).))))))))).....)))))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....((((((....((((.......(((((.,,.,((((((.,.......}.))))}}..,{.(((.((.(((((.((((.(((....))).)))),(({((..,{{|....}}},,,,}}}})))}...(((((((.,(((...((.(((((.(((.((((((..(((((.(((((..((((..(({(((..(..(((...))).,..))).,),,))))((((....))))(((((((((((((((((((..(((((((,,(((,{({,(((.((((.((((......)))).))))..)))......{|||,{(({(((......}))}...}||.}}}}...,|,..|,,.}|||,,{{{{||,.....)))})).}}}..),})))))..,)},}}))))..........)))))},)))))........{{{....)},......)))))))))))))))).....((((((.(((((((((....(((.,(((...))),.))).{{{..{((.,.........,|{{({{(((((((.....)))))))..})}}}.{,.......{((.((((((((......(((((,,((.(((..............,..))).)))))))))))))))).))}((((......((((..(((((((((((.{.({({..,,,,.,{{,{{{||(........,|||{}|||||{,,.(((((.,.(((...((((((((((.(((((((((((.{{{{.(((..,..{{((((.,.....}}.}}}},|},}}}}...|||,,,...{{{,,,...,,))}...,))),))))))))).,{{....}}|,,,.((((((((.......))))))))..(((((((((((({((..(((((((((((........)))))).)))))..)),))),.((((((..{{|{(((({|.,((((((((((....((((,(((((((((((,,((({(,(({((((.,....,,.,.,...)))))}}..})))}{{{{{{{.,,....(({.(((((......)))))...))).......})))))))...))))))))))).{(((((((..(((..(((((..((((...........))))..))))))))..)))))))},.......,......{{,.,{||||,.....,}||,,,,((((((......,.((((((((((((....((((....((((....))))......))))..)))))))).)))).,.....))))))..}}...,.))))...)))...))))))}...,,,((.,{{(((,{((((,..((((((((((((.......)))))))..)))))...))},...}))))}}}),))).}}.,,,|||}))))}}}}}.,,)))))),....}}))))))))...(((((((.{(..{((((...}}))),,......)))))))....((((((((.,..((((.{.{..((.(((((..((((((..((((...(((((.(((((((....(((((.((((.((((..(((((((...))))..)))....)))).))))))).)).....)))))))((((.((((((,.{(.((((((((.(((...))).)))))))).)))))))).))))((.((.......))))...)))))...)))).)).)))).))))).)).....,.))))..)))))))).....{{{{,.,...,},})})),,.........)).))))))))))...))).,))))).,,},{{.||||||{...,.}},}))))))}.}),..,.))))))))))).))))))))..)))..}))...))))))))))))))).)))........((((((((.(.(({...}))).)))))))).))))).))....))).,..)))))))))))).)))))...}}.))))))))).....)))))).......
Forensic Context

No forensic context available.