Basic Information
Symbol
hsa_chr8_0392300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CHD7_0067
Host gene
CHD7
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
8:61739114-61741347
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:60826555-60828788
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-524.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-572.98 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
702.36
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.(((........))).))))...(((((((((((..((((.(((........))).))))..((((((((((((.((((((.((((((.(.((((....((((((.((.(((((((((((...)).)))))))))...))....................................((((.((.(((((((((((..(((((((...((.....(((.(((..(((((((...)))))))......(((((((.((((.((((((((((((.(((((((((((..((((((((.((....((((...(((....((....))..)))))))....)).)))).))))....((((((.((((((((..(((((..((((((..........(((((...)))))...........)))))))))))..)).)))).............((((.....)))).....)).))))))(((((((((((((.((.((((((.......((((...(((..........(((.....))))))..))))...))))))))))))))).....))))))...))))).))).....))).)))))))...........((((.(((..((((..((((.(((((((((((............((..((((..(((((((.......((((((((.....))..)))))).)))))))..))))..)).......)))))))))........)).))))..)))).)))))))))))))))).)))............)))).....))).)))..))...)))))))...)))).......)))))))........(((((((...((.(((.((((((((((..(((((((((.(((((...(((.....(((((((...((..(((....))).))..))))))).....))).((((((((.((.....(((...((((......))))...)))))))))))))..)))..))...)))))))))..)))))).)))).))).))...)))))))..........(((....(((((.((((((((..((.((((.(((.(((((((...(((((....))))).))))))).)))..)))).))...))).((((((((.(....((((....))))).)))))))).........))))).)))))....)))..........(((((.....)))))....((((....))))...)))))).........))))))..)))).).))).))).))))))..).)))))))))))........(((.............)))..((((((.((.((((((((((...(((((((.(((((..........................))))).)))))..))...))))))))))................((((((((.....))))))))..............(((((((...(((((((((((((.....)))))))))))))..............)))))))...((((((((((((((((((((......).)))).))))))))))))))).....(((((...))))))).))))))........((((.(((((....))))).)))).)))))))))))....(((((.(((...((((........))))((((((......(((((......(((........))))))))......))))))))))))))...............)))(....(((((((.((((..........(((((.....(((((((((((((........)))))........((((....)))).))))).))).....)))))(((..((((((.((((.((((((((.............))))))))..))))(((((((((((((((...)))))).)))))))))...))))))..)))((((.((.(((((((.((((((((...(((((((....))).))))...(((......)))(((((...)))))..))))))))...(((((((((((((.(...........))))))))))))))..((......))((((((.((....)).))))))))).)))).)).)))).(((((((((.(((((.(........).))))).))))))))).......)))).)).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.,((({(((.,{{{{{,.|{{||||.,.{{{{((((({{{{(,,({(,,......{{||,,,|||{{(((((((((,,..(((({({(((((({,{((((,,,,{((((,,((,({{{|||||{|,,,)).}))}}}}||,,,|}..,,........,{{.......,,,.,,},,.....,,|||||,{,,,.,,{(({{,....{((({{{.,({{..{{{{{{..(((((((...)))))))...,{||.|}||....,||||,,.}}|}}||.,...,,|}}}}}.((((((((.({....((({...{{{.,..||.,,.}}..}))))))....}}.)))),,)))....,,,,.,.,.{(((((..{((((..{(((({..,{......(((({...}))}).....,,.,..})))))}}}},.,}}.,,,}..,,|...,...,|||{.,.,,)}}),.{{{||.{{|.||.{,,||,|||,,|,||},{{,,,.......,|||,..,,,......{{{.{((,...,|||{||...||{((,.|||||||||,}}}}|....}}|||}..,}}},|}},,...,,.{{{({{...)))}}}......,{,(,((({{((((,.{{,,{((({{{{{{,|.,}..,,,,,,,,,,..,,,..,|||||}},,,..,,,|}}))))}}.)))}.,,})}},}}}},,...,,,,...,......}))},,,.))}}}}}}....}))))}.),))}),|,,....}}},,)}}|||,,.,,.,}}},}}))})}..{{|||,.(((((.{..((((((((((....,,.(((((((((((....)))))}......}}))),}}.......})))))))}})..).)))))...(((..,..(((((((...({..(((....))).}}..)))))))..}..))).,,,|||||....,}}}|||.}}(((({.{{.{||||{{{|,,}||}||||}|..}}}}.}}...,|,|{|{||,,{||{{(({(({.{{....}}.}))),,..,,,},,},,,))}},}))}||.((((({{{,,{{,{{{|.{((.(((((((...(((((....))))).))))))).))}..||||{|,....,..||,||||{,|}}}}||(({{{{|||,..|||||||,{{{.{{,..,,,....|||,{{{{||............,,,,.....}}}||....((((....))))..,||||||{...,,,,.||||}|..}}}}...|||{|||{,}}|||,{{.,,|||(((||,.....},||,.,,,.},..}},,})))..|||||,.||}|{|{||{({(,{{{,{{(({.(((((......,{,.,...............}}}}}.}}}}}..,,...})))}|||||,,..........,{{{((((((((,...,)))))))).}}},.........{{{{{{{...(((((((((((((,....}}))))))))))),,,,..........}))}}},...((((((((((((((((((((......),}))).)))))))))))))))..,..(((((...))))),,.,,}}}}.,......((((.(((({....,)))).)))).}}},,,,}},|,,,.(((((.(((...((((........))))((((((....,.((((({....,{{{........}})))))).,....)))))))))))))),,,,...........||}{....{{|{{{|.{{{{..........(((((.....((((((({{((((........}))}}........{{{{,,,.}))),)))))},)).....))))).....,,{{{{{{{|{|{((((({{.,,.......}},)))))})},})}},(((((((((((((((...))))))},)))))))).,.,,,},,,,.}}|}|},,,...|}}}}|(((((({{,.{(((((((....))).))))|,{(((......)))},{{,,}}}),)},,))))))))}..(((((((((((({,(...........))))))))))))))......}}}})),))),))),)))))))))),......})))}))))....(((((((((.(((((.(........).))))).)))))))))..}}}}})))).)).)),)))
Forensic Context
No forensic context available.