Basic Information

Symbol
hsa_TMEM165_0003200
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0069776 hsa_circTMEM165_007 hsa-TMEM165_0002
Host gene
TMEM165
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
4:56277781-56290810 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:55411614-55424643 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-186.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -200.27 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 165.6
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......................((((((...(((((...(..(((((((...((((((....)))))).........((((((((((((..(((..((((.(((....))).))))..))))))))))............(.((((((.(((((((..(((.......))).)).))))).)))))).)((((...))))....((((...(((((....))))).....))))(((..((((.(((((((..((((((.((.((((((.......((((((((.(((((...(((((....)))))....)))))(((((...((((((....)))))).((((....))))....(((((......)))))...)))))....................(((((..((..(((..........)))..)).)))))))))))))((((((..........)))))).....((((((....))))))...((((((..(((((((.(((................))))))))))..))))))((.(((((..((((.(((....)))))))......)))))))........)))))))).)))).)).)))))))))))..))).))))))))))))..)....)))))........((((((...(((...)))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
...................,{,((((({...(({{{...,..,,{{(({,..((((({....})))))......{(,{(((((((((((..(((..((((.(((....))).))))..)))))))))},..........,{.((((((.(((((({..(((.......))).)).))))).)))))).}{{{|...,)))...}||{{...{((((....)))))|||,{||,.(((..((((.(((((((,.{{((((.((.((((((,,,....{{(((,,,.(((((...(((((....)))))....))))).{{{|},.((((({....})))))|||,{,,||||||....(((((......)))))...||,.......,,,....,,{,.....{{(({,({..((,..,.......,))..})}}.,,)))))))},((((((..........))))))..,,.((((((....))))))..,{(((((..(((((({.{{{...,,...........))})))))))..)))))}{{.(((((..((,,,(((....)))}}),.}}.,.)))))))}}},}}},)))))))).)))).)}.)))))))))))..))).,,)))}))))))))},,.})))))}}......{{{{{(.,,(((...,}))))))}},,)))
Forensic Context

No forensic context available.