Basic Information

Symbol
hsa_ACTN4_0004300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ACTN4_0084
Host gene
ACTN4
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
19:39196684-39215205 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
19:38706044-38724565 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-556.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -580.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 383.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..((((((((..(((((..((.(((((((....))))))).))((((..(((((.......(((((..((....(((((((....).))))))..((((((((((...................)))).))))))..))..))))))))))....))))(((..((..(((...))).))..)))........)))))....))))))))......))(..((((.........((((((.(((.((...((((....)))).))(((((.((((.(.((((............((((((((.....(((((((((((...((((.(((((((((.(.....((((((....)).(((((.(((((((.(.(.((......)).).).))))))).)))))............((((((((((...((((((((..(..(..(((((((..(((((.....)).)))..))))))).....)..)..)))))))).((((((...((((((...(((((..(...((((((((.((......))))))...))))..)..))))).))))))((((.....)))).....))))))......)))).)))..)))...))))).)))))).))).)))))))))))...)))))).))))))......((((((((..(((((((((..((.(((...(((....((.(.((((((((.((......)).))))((((((((..(((..((....))..)))..))))))))...(((((((.......)))))))(((((((((((((((..(((...(((...((((((..((....(.((((((.....(((....((.(((.((((............)))).))).))...)))..))))))).....))..))).)))...)))...(((((....((((((((((((...)))))(((..........)))......(((..(((..(((..((((...))))..))).))).)))(((...)))((((((........((.(((((...))))))).....)))))).((((((((..(....)..)))))))).))))).....))...))).)))))..)))))......(((((((.(((((((.(((((...)))))))...))))).))))))).....((((.....))))((((.((....))))))....)).)))..)))))...(((((.(((((.(((.((..((.(..(((.(((((((((.(((....)))))))...))))).)))..).))..))..)))..)).))).)))))...........))))).))..))).....)))))..)))))))))(((...(((((((..((((((.((.....)).))).(((((((...)))).)))..((.....)).........)))..))))))).....)))))))))))))))..).)))).)))))))).)))))).....))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((..((((((((..({{(((((,,(((((((....))))))).)..})))}{((......}}}.{,.{||,{,{..((((({..,,,|,|}}}}}..((((((((((...........,,......)))).)))))).,{|{..,,.,,,......})))}|||}||({{{....})))..,...))}.,},.,}}})))....))))))))......))(..((((........,((((((,(({,((...((((....)))}.|}(((((.((((.,.((((...........,(((((({(,.,{{{,{,(((((((...((((.(((((((((.{.....(((({{...,)).(((((.(((((((.(.(.((......)).).).))))))).))))),.....,.....((((((((((...((((((((.,(,.{..(((((((..(((((.....)).)))..))))))).......,),.)))))))).((((((...{(((((...,(((({{(..((,,,((((.((......))))))...))))}.)},),}}}.)))))}((((.....)))).....))))))......)))).)))..)))...))))}.)))))).))).))))))))))).,,}))}}}.)))))}......((((((((..(((((((((..((,(((...(((,,,{(,,(.((({((((,({......}}.}}}}((((((((..(((..((....))..)))..))))))))...(((((((.......)))))))((((({{{{({{{((..(({.{(({,..((((((((.,,.,{{{.{(({{......|||{.,.{{.,,(,((((..,(,...,..,)}}),}}}|},|.{||,,{|({{{{{{{.{,||{.,,||||||.||||.,|||,{{,...||{||||{((({...})))){,........{{{||,......}}}....}}}})}}},,,....|||||..||||}||,..,(({,,|||({({((.......,||,{||||...)))))),....,))))},.((((((((.,{....)..)))))))).}}|||.....,}},.},))),)))..}||}}......(((((((.(((((((.(((((...)))))))...))))).))))))).....{{||}}.},}})}||||,{{.,.,)))))).,,.)).}}}}.}))))...(((((.(((((.(((.((..((.(..(((.(((((((((.(((....)))))))...))))).)))..).))..))..)))..)).))).))))).........,.}},})}),..})|.,...}}}}}..}}}}}})))||,,..|||||{{,.{{((((.((.....)).))),(((((((...)))).)))..{{..,,,))..}},....})).,))))})),,,.,)))))))))))))))..,.)))).)))))))).)))))).....))))..)
Forensic Context

No forensic context available.