Basic Information

Symbol
hsa_CHD7_0014300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CHD7_0149
Host gene
CHD7
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:61761610-61768761 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:60849051-60856202 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-595.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -628.06 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 406.38
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(..(((((((((...(((.(.(((....((((((..(((((((.....(((((((....(((((((((((..(((((((....((((((((.....(((....)))......)).))))))..((((.(..(((((((((..(((.((((...((.(((.((...(((..(((...(((.......)))..)))...))).)).))).))....)))).))))))).)))))..)..))))...((((((((...(((((((........((.(((..((((((.((((...(((((((((.(((((((.(((((((((..(((((((((........))))(((......)))(((...))).....((((.(((....(((((.(((((((((.......)))))))))............(((((((((((((((((((((((((..((((....((.(((((......)))......))..))...))))..)))))).....).)))))))))))....((.((.((((..........)))).)).))(((((((..((((......(((......(.((....)).)......))).....))))..))))).)))))))))...(((....(((((((....))))))))))...))))).))).))))...........((((((.....)))))).........))))).))))))))).))).....)))).)))))))))(((((((((.(((.(((...((((...((.(((((.......)))))....)).))))))).))).))))..)).)))..(((((((..((((((..(((((..(.((((.(((((((((((((((.((((...))))..)))).)))).......((((((.((((.(((.((((((..(((.....))).))))))...))).))))..))).))))))))))))))...)..))))))))))).((((((.(((((..(((((((((((....((.((((......))))))..)))))))).(((.(((((((((..(((.(((........(((((.........)))))(((....(.((((((((...(((((((((((((((.(((...(((.((((((((.(..((((((((...........))))))))..............(((...)))..).)))))))).))).))).)))))))))).........))).))........)))))))).)..))).)))))).))))))))).))).........)))..)))))..))))))))))))).........)))).))))))..))).))........)))))))...)))).))))(((((..((((((.....((.............((((((((((..(((....))).....))))).)))))))......)))))).)))))))))))).....(((.((((((..((((.(((((....))))).)))).............(((.(((...((((.(((((((......))))))))))).))).))))))))).)))...((((((((((...........(((((....................))))).(((((.((((...))))))))).))))))))))(((........)))......)))))).)))))..(((((......))))).....)))))))))).))))....((((......)))).((((.(((((.(.......).))))).))))))))))....)))..).)))...)))).)))))..)))).((....)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({,(..(((((((((.,,(((.,.(({,{{,((((((..(((((((.....(((((((....(((((((((((..(((((((....((((((((,,...({{....,}}......}),,)))))..{(({,(..(((((((((..(((.((((...((.(((.((...(((..(((...(((.......)))..)))...))).}).))).)).,..)))).))))))).)))))..}..}}}}...((((((((...(((((((........((.(((..((((((.((((...{(((((((,.(((((((.(((((((((..(((((((((........)))),{(......}}|(((...))),.,,.{(((.((,{{..{(|{{.(((((((((.......))))))))).,.,||.,.||,}||.,.(((((((((((({(((((..(((((.,.{((...))}.....})))}...,,}},{((.....))},,,.,}......}.))))))))))))|{.{{,((.{{{(,..,,,,..,||||,|}.||{{{{{{{..{(((.{{...(((......(.((....)).)......)))..,,.))))..))))),)}))|||||.,}||}....(((((((....)))))))|,....||||,.,}}.}))),..,,...,,.{{((((.....)))))).........))))).))))))))).))).....)))).}))))))))(((((((((.(((.(((...((((...({.(((((.......)))))....)}.))))))).))).))))..)).)))..((((((({,{((,,(((((({{..((({((.((((,,.{{{(((((.((((...))))..)))))|}}}{(({,{.({(((,.((((.((({{{{{{{..|||},.||||}.||||||{,.||},||}}..))),}}}.}}})))}||||||,{|||}}.},,})))))||||}|||{{..{{.((((((((....((.((((......))))))..)))))))).(({.(((((((((..(((.(((....,,,{(((((.........)))))|||....,.((((((((...(((((((((((((((.(((...(((.((((((((.({.((((((((...........)))))))).,,...,.......(((...)))..,.)))))))).))).))).)))))))))).........))).)).,,.....)))))))).,..,,,.)))))).))))))))).}))..}}.}}.,)),}})})))}}))}.})))))))).........)))}.))))))..))).))........)))))))...)))).))))(((((..((((((.....((.............((((((((((,,({,...,))).....)))))))})))))....,.)))))).))))))))))))....,(((.((((((..((((.(((((....))))).))))...........,,(({.{{{...((((.(((((((......))))))))))).))).))))))))).))),..((((((((((,{{{{{,,...{{{||,,,.},}.............}}},}.(((((.((((...))))))))).))))))))))(((........)))......)))))).)))))..{((((......})))}.....)))))))))).))))..,,((((....,,)})).((({.(((((.(.......).))))).))))))))),...,)))},).)))...)))).)))))..)))).((....)).
Forensic Context

No forensic context available.