Basic Information

Symbol
hsa_CHD7_0014500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CHD7_0096
Host gene
CHD7
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:61763591-61773684 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:60851032-60861125 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-732.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -776.74 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 529.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((.((((.....((......))................((((...))))..................))))))))))))))).....((((........)))).(((...((((((.....((((.((((((((.(((((.......(((((((((.......)))))))))...(((....))).....(((((((((((((((((((..((((....((.(((((......)))......))..))...))))..)))))).....).))))))))))))(((((.((.((((..........)))).)).(((((((((..((((......(((......(.((....)).)......))).....))))..))))).))))((((...))))....(((((((....)))))))......((((.(((((((((((.((..(((((((((((((((((.((.........(((((.((...((((((.(......(((((((((((((.((((((.((..((((.((((.....)))).))))....)).))).......)))))).(((((((((((....(((((....((((((...((((...))))..)))))).((((...((((((((.((((...))))..)))).)))).(((((.((((((.((((.(((.((((((..(((.....))).))))))...))).))))..))).))).((.(((.((((((.((((........))))..))))))))).)).((((((((....((.((((......))))))..)))))))).(((((((.....))))).))..........(((((.........)))))(((....(.((((((((...(((((((((((((((.(((...(((.((((((((.(..((((((((...........))))))))..............(((...)))..).)))))))).))).))).)))))))))).........))).))........)))))))).)..))))))))..)))).(((((((((.....((..((((..(((((((((.(((.............(((....))).(((((.((((((((((((((((.(((..((((.((((.(((.....))).)))).)))).....)))....(((((((..(((.....)))(((((...)))))((((((......)).)))))))))))(((.(((((((((((.(((...((((.(((((....))))).))))((((((((((...(((.((((((((.((((((((((.(((............))).).)))))))))..))))...((((((.(((.....(((((...((((((....(((...(((((((((((((((((((.(..((..((((....(((.....)))....)))).)).)))))))))..........(((((((.....((((......((((....))))..(((.((((......)))).))).(((((.(((..((......))...)))))))).((((((..((....)).))))))((((((((..(....)..))).))))).((((..(((((((((.........))))).))))..)))).....)))).....)))))))....((((((......(((((.(((((...)))))..))))))))))).....)))).))))))).)))........((((.......))))...))))))..)))))....))))))))).....)))).))).....))))))))))))).)))))))...)))).)))............)))))))))).)))).....))))))).((((.....))))))).))))))).)).)))).)).....)).)))))))...)))))....))))).))))))(((((........)))))(((((((((((......(((((.(((.(((.((((..((((((.(((((((...(((.((((.(((....)))..)))))))..)))......)))).))))))))))...))).)))..)).))).......))))))).))))))))))))))))))))).))))))).((((((.(((....))).))))))...)).)))))))))......))).))))).....)).))))))))))).))))..)))))....))))).))))).)).).))))....)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((.{{{,.....{{......},................{{{{...}}}}.....,,.......,...)))}))))))))))){....((((........)))).|((...((((((.....((((.,(((((((.(((((.,,..,.(((((((((.......)))))))))...{||....|},.....(((((((((((({(((((..(((((.,.{((...))}.....})))}...,,}},{((.....))},,,.,}......}.))))))))))))(({((.((.((((..........)))).)).{((((((((..((((.{,...(((......(.((....)).)......)))...,.))))..))))).))))((((...))))...,(((((((....))))))),.....((((.(((((((((((.((..{((((((((({(((({({((,.,,,,,,.,{(((.,{.,.(((({{.,.....,{||||{{{||||||{({|{{|{{,,||((,{{{{.,,,.,))).||||..,,}}.}}}......,}}||,..,((((((((((....(((((,...((((((...((((...))))..)))))).((((...(({(((((.((((...))))..))))),))},((({(.((((((.((((.(((.{((({{..(({.....))).}}))}}...})).))))..))).))).||||||,((((({,(((|,,.....}))))},))})))||..||.((((((((....((.((((......))))))..)))))))).|||((((.....))))},,|......,{,{(((((.........)))))|||....,.((((((((...(((((((((((((((.(((...(((.((((((((.({.((((((((...........)))))))).,,...,.......(((...)))..,.)))))))).))).))).)))))))))).........))).)).,,.....)))))))).,..,}},}))),,)))).(((((((((.....((..((((..(((((((((.(((,.,,.........{{{....|||.(((((,{{((((((((((((((.(({..((((.((((.(((.....})).)))).)))).....}}}....(((((({..(((.....)))(((((...)))))((((((......)).))))}))))))(((.(((({{{{(,,,(((({,((((.(((((....))))).))))((((((((((...(((.(((({(((.((((((((({.(((...,....,.,.))).}.)))))))))..)))}...{(((({{(((.....(((((...((((((....{{{...(((((((((((((((((((.,..((..{(({....(((.....)))....}))}.)).})))))))},,.,{{{...(((((((.{{{,{{{,......((((....))))..(((,((((......)))).))).{((((.(((..{{.,|,..}}}.,)))))))}...,)))){((((.....))))).((((((((..(....)..))),,)))).((((..(((((((({.........)}))))))))..)))).,...,,}}.....))))))),...{(((((,,....((({{.{((((...})))}.,}}}})))}))),,.,,)))).))))))).|||.....},,{({{.......))))...))))))..)))))....))))))))}.....)))).))).....)))))))))))))})))}})}...)))).)))...,,....}}.)))))))))).)))).....}))))},.{(((.....)))}))).))))))).)).)))).)).....)).)))))))..,)))))....))))).)))))|(((((,.....,.)))))}((((((((((......(((((.(((.(({.((((..((((((.(((({{{...,{{.{(((,((,...,||,..}}))))}.,))),,....)))).))))))))))..,)}}.}))}.))},)).......)))))))}))}}}}}}})))}}}||}}}}.}}}))}|{(({(((.(({....))).)))))).,,})}))))))))}}.....}))}}))}}.....)).))))))))))).))))..)))))....))))).)))))},).,.))))..),)))))))))
Forensic Context

No forensic context available.