Basic Information

Symbol
hsa_CHD7_0014600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CHD7_0134
Host gene
CHD7
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:61763821-61775211 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:60851262-60862652 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-795.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -840.46 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 850.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...(((((((((((((((((..(((...(((....)))(((......)))(((...((((.((..(((.((.((..((..(.(((((((((.......))))))))).)..)))).)).)))...(((((((((((((((((((..((((....((.(((((......)))......))..))...))))..)))))).....).)))))))))))).(((((((((...(((((((((((.(((...(((((..((....))......((((...((((((..(((((((((.((...((.((((((..(((((.(.(((((((.((((.....(((((((....)))))))((.(((......))).)))))))))).....((((((.....)))))).((((((...((((..((.((((....)))).))))))...))))))(((((((((.(((.(((...((((...((.(((((.......)))))....)).))))))).))).))))..)).)))...))).))))))..))))))))....))))).)))).))..)))))).))))...)))))...)))))))(((.((((.(((((((((.((((.........)))).)))))...((..((..((((((..((((((((.((((((.((((((.((((........))))..)))))).......((((((((....((.((((......))))))..)))))))).(((.(((((((((..(((.(((........(((((.........)))))(((....(.((((((((...(((((((((((((((.(((...(((.((((((((.(..((((((((...........))))))))..............(((...)))..).)))))))).))).))).)))))))))).........))).))........)))))))).)..))).)))))).))))))))).)))...(((..((.....((((((.....)))))).....))...)))...((.(.(((((((((..((((((((((.......(((.(((((((((..((((((.....((.............((((((((((..(((....))).....))))).)))))))......)))))).))))).))))..)))..(((.((((((..((((.(((((....))))).)))).............(((.(((...((((.(((((((......))))))))))).))).))))))))).)))...((((((((((...........(((((....................))))).(((((.((((...))))))))).))))))))))(((........))).)))).))))))....))..))))))).)))...)))))).))))))))..))).)))..))..))....(.(((((((....))))))).)(((.(.(((...)))).)))...)))).)))))))..))))).((((((((..(....)..))).))))).((((..(((((((((.........))))).))))..)))).......))....))))))))).....))))))....))).....(((.(((((.(((....))).))))).)))((((..(.(((((..((((((..((((.......))))..)))).))..))))).)..))))(((..(((((((((((.((..((((((.((((((((((((((((((...((((((..(((....))).((((((((..(((.((((((((((...((.....((((.(((((((....(((.(..(..(((((.....(((((((..((.((((((.((((..((....))..))))..)).)))).))...))))))).....)))))..)..).)))))))))).....))))..))....)).))).))))).)))..))))))))))))))...)))).))))))))).....)))))((((((((............(((..((((.(((((..(((.((........)).))))))))....((((...))))))))..))).))))))))........((((.......))))(((((((....)))))))...(((((((.(((...(((((((..((.....((((((.((((.(((.((((.....)))).)))....((((.......))))......(((((....))))).............)))))))))).))..)))))))...)))..)))))))(((((.((.......)))))))))))))..))))))))))).))..))))))..)))))))(((..((((....)))).))).......))))))))))......)(((((((((((...)))))...))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,..(((((((((((((((((.,(({...(((....))),{{......|||(((.,.||||.,,..(((.((.((..{{,,{.(((((((((.......))))))))).}.,}}}}.}).)}}...(((((((((((({(((((..(((((.,.{((...))}.....})))}...,,}},{((.....))},,,.,}......}.))))))))))))|{{{({((.{{{{|,.,,{{{,,||||,||.(((({{{((..{(((.,,...(((......(,((....||,|....,.}}},..|,|||}..}}}}}.}||}{((({.,||||,...(((((((....)))))))|,,...{{({.,{{{{{|||{{.{{..,||,{{((((,,{{,|{|({,.,{{{{,..,(({,.,,|,{{{(|{.,,,,,.}}))}},|,}}))))||||||}||,||||(.{{{{,,,,.}))).||||..,|||.,}}.}}.,|||||||,.|{(((((({||..,|(,{{||,|,{||||({{{(((({{{|||,..|}|}|}.||||...{{|(((((.((({...))))..)))))}))},{{,,,.{{(((,.{{||,{|||||||||..|))),,|||||.||{{|,{{.,{|{|||,.{|||{|||.(((({{.((((({,((({,,.....,))))),))})))}}..,,.((((((((....((.((((......))))))..)))))))).({{.((({{{{{|,,|((.{{{....,,,{(((((.........)))))|||....,.((((((((...(((((((((((((((.(((...(((.((((((((.({.((((((((...........)))))))).,,...,.......(((...)))..,.)))))))).))).))).)))))))))).........))).)).,,.....)))))))).,..,}}.)))))),)))}|||||,|||...{{(,.,(,{,..((((((,,,.,}}}}}}.....,,...}}}...((.{,(((((((((,,((((((((((.,{{..{(((.(((({((({..{{|||{},,,.||,}.....|,....{((((((({{{{(,....}))|,,,,.,})))))||||||......))})))}))))),)|||.{|||.,{((.{{((((..((((.(((((....))))).)))),{{{{{{{,,...(((.{((,,,(({(,(((((((,.,,,.}}}}}}}}}}},)),,}))))))))},,)},.{{{((((((({((,,,..{{{({.,||||{||,...,,,...,,,,|||||,(((((.((({...})})}))}}.,}|||}}}}}|||........})).)))),))))}}....}}..|||||||.}}}.,,|}}}}}.}||||}}}.,))).}||{,|{{{......}}})|))}|.||||.|||}}|,.||,|,|||},}}||}}},...,)))}(((((.....))))).((((((((..(....)..)))},)))).((((..(((((((({,......,,)})))))})).,)))).}.....}}.....}}}))))}...{{{{(({{....||||,.,{(((.,||||}}|{}},})))})))},,}}))))}}}}}|||{|},,,,,{|..((((.......))))..}))),))..))))),|..}}}||||,.{,{{{||||{|}|,..{{||||,||||||||||||{{|{{,.,,||{|||..,{{....,},}||||||||,.||||{{,,,|||||...{({,...{{||,|||||||}}}}|{|,{,,|,.||,{{..},.|||||||..{|}|||{{{.||||,.||,,,,||{{|}}}..,).))))})|{,,||||||}.....|||||.{|{.|{|,||||,|||,{{{.||||,.,....,|,.|||.||}}}.}))..}))))))),))))}...,,)))),)))))))},,..}))),||||,|||.,,.......}}}||}}|||||||{{{|||||,({|,.,.,,.}|,||||||||.{{{.,,,})}.}})))),,,})))))))))))},,,..,,|{{|.......}))}|||||||,,,,|)))),|{,.(((((((.(((...(((((((..((.....((((((.((({.(({.((({.....)})),}}}.,,.{(((.,.....))}}.,}...(((((....))))).............}))))))))}.}}..)))))))...)))..))))))),||||,|}.....,},,,,}}))}}))}..})))))))))).)),,))))))..))))))){{{..((((....)))).}},....,,.))))))))))......)(((((((((({...}))))...))))))
Forensic Context

No forensic context available.