Basic Information
Symbol
hsa_AFF1_0004000
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0001423
hsa_circAFF1_005
hsa-AFF1_0001
Host gene
AFF1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
4:87967318-87968746
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:87046166-87047594
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-280.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-300.83 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
245.43
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..........((..(((..(((((((...((((.((((((((.(((.(((.(((((...((((.((......((.(((.(((((.((((((......))))))))))))))))((.(((((((............))))))).)).............)).))))......(((.((.(((...(((...((((....)))).))).))))).)))))))).))).))).......((((.....))))......))))))...)))))).....)))))))..)))..))..(((.(((((..(((.(((.....))).))).............(((((((((.........((((((........(((((........).))))..((((..((((((.(((...((((.((((((.(((.....(((((((....)))..))))..)))(((((((.(((....))).)))))))......((((((((.((((((........))))))...)))))))).))))))...)).))...)))..))).))))))).(((((.(((((((........(((.....)))........))))))).))))).................)))))).........))))))))).))))).)))..((((..((((((..(((.....(((...((((.......))))........(((((..((.((.((((.(((((........(((....)))..........((((((.........)))))).......................................((((((...)))))).(((((...)))))...((((((....((.((((..((.(((((..............))))).))...))))))))))))))))).)).)).))))..))))).........)))......))))))))).)))))))((((.(..(((((.((.....)))))))..).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.........,.{{{....|||{{((({..,,{.(((((((..{,,.(({.{((((..,((((,((,,....((.(((.(((((.((((((......)))))))))))))))),,.((({(((...,,,,,,|,,|}}}}}}.||.....,,,,....}},}}}}......(((.(,{(((..,({{...||{{....)}}},))).))))),))))))}}.))),})},......(((((((,,,{..{,.........,..,}},,,,,..{((((((.,,..........)))}))}.|,,.,,.|||.,,,,|||.|||,..,{({(..((((((((((((.........((((((,.......|||||........}.}|||,{((,,..,,,|||.,{{...(({{.((((((.,{{.....(((((((,,..}}),.},)),.}}.(((((((.(((....))).)))))))....|,((((((((.((((((........))))))...)))))))),))))))...)).))...|||{{{{{{...(((...((((((((((....))))),...}))}}..)))......,}......,)))))))}}............}}}}}}.........)))))))),,))).,..((.((((((.(((,,{,.((((({.,.,....,}}))))))...))}....,,.,}}.)))))).)).)))}}.|||,..,.....(((....)))..,,,...,)))))),.,}},}}}}))).))))))),,,....,,,...,,..,................((((((...)))))).(((((...)))))...((((((....((.((((..((.(((((..............))))).))...))))))))))))}).,,.}))).}||||.,{{((,,,....,,,.,|,.,,}).}.))),....,.))))((((.(..(((({{((.....)))))))..).))))
Forensic Context
No forensic context available.