Basic Information
Symbol
hsa_chr19_0222700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ACTN4_0040
Host gene
ACTN4
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
19:39204041-39204340
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
19:38713401-38713700
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-124.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-128.00 kcal/mol
Frequency:
0.0025
Diversity:
51.22
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..............(((((((((.(((....((((...)))).((((((....)))).))))).)))))))))((((((((.(((((..(((....)))((((((.(((....))).((((.((((((.(......).)))))).)))).)))))))))))((((((((.......)))..(((((..(((.(((.((((((....(((((.((....))..))))).....)))((((.((((...)))).)))))))...))).))).)))))))))).)))))))))))(...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({{,.,,.........(((((((((.(((....((((...)))).{(((((....)))),.,))).)))))))))|||||{{{{(((((..(((....)))((((((.(((....))).((((.((((((.{......}.)))))).)))).)))))))))))|(((((((.......)))..(((((..(((.(((.((((((..,.(((((.((....))..)))))..,..)))((({.((((...)))).}))))))...))).))).)))))))))).}))))))))))|...)
Forensic Context
No forensic context available.