Basic Information
Symbol
hsa_CNTRL_0001600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CNTRL_0038
Host gene
CNTRL
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:123850574-123858841
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:121088296-121096563
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-108.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-117.79 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
134.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((..((((..(((((((.....)))))))..))))(((((((......................(((......)))..(((((.((.((.(((...........((((..((((((...((((.........(((((((...))))))).....))))))))))..))))))).)).)).)))))...)))))))((((((((.....((((((((((((((.((....)).))).)))))))))))...((((....)))).((((.(((((.........(((((...((((......))))...)))))...))))).)))).((((......(((.((((..........)))).)))......))))........(.(((((.....))))).).))))))))...(((((((.(((.(((((((........))).)))).))).)))))))............((((((((...((........))...)))..))))).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,{{((,(((..((((..(((((((.....)))))))..))))..}}}.}}}},.......,,....((((((((....,{.{{{((((({{{{,,,.{(,((((((,..{.((((..((((((,,({((((.{..{{,.,..|||..)))}}))})}}.},}...))))))..))))})}.,)))))).)),..}),}))))|(((((({.....((((((((((((((.((....)).))).)))))))))))...,{{{,,...,,,,{,,,..||{|...,,.||,{|{{|{||((,({{{{{.,,,,...)))))|..|}))}||,,..((((......,{{.{(({..........)))}.}}}......))))........{.(((((.....))))).).)))))))....(((((((.(((.(((((((........))).)))).))).)))))))...},.,.....})))))))..{{(.{{....,)}..})}.....||,.,,})},
Forensic Context
No forensic context available.