Basic Information

Symbol
hsa_CNTRL_0003000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CNTRL_0057
Host gene
CNTRL
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:123852553-123870273 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:121090275-121107995 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-158.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -174.57 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 123.84
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((((........)))))))..........(((..((((((...........................(((((((.........((((.(((((((((((((((.(((((.((........((((.....)))).....(((((((.((.((.(((((.((.(((.(((.......((((......))))(((((..(((.(((((((....((.((.......))))....))))))).)))((((((....(((((........(.(((((.....))))).).....((....)).(((((.(((.(((((((........))).)))).))).)))))((((((((((((((.((((.(((.((..((((((((............(((((..........)))))...)))))))).)))))...))))))))))))))....)))).))))).......))))))...)))))))).))).)).)))))))))))))))))).)))))..)))))))))..))))))))))..........(((..(.....)..)))(((((((((...((((((((.......((.......((((........))))........)).....))))))))...))))))))).....((((.((((((((..............((((......))))..............))))).))).)))).......)))))))))))))..)))....(((.......))).............
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(((((((........)))))))....,,,.,.(((..((((((.................,},......,(((((((.........(((,{(((((((((((((((.(((((.((.....,,{((,,.....}),,},,,,{(((((((((.(,{(((((.((.(((.(((.,,,{|{((,{.,,,,.,|,|{{,||,,|{{.{({((({....((,({......,|,||,...}}}}}}}.))),.,,,.....,||||.....,{,{.(((((.....))))).}....,||....,{((((((.(((.(((((((........))).)))).))).))))))|{,(((((((((((((((.(((.((..((((((((............(((((..........)))))...)))))))).)))))...)))))))))))))),...}}}},}}|},.....,})})},},..}}}},))).))).)).)))))))))))))))})).)))))}.))))))))}.,)))))))))),,.,,..,,.(((.||.....)..)}}(((((((((...((((((((.....,..,.......((((........)))).........)..,..))))))))...))))))))).....((((.((((((((..............((((......))))..............)))))}})).)))).......)))))))))))))..)))....(({.......)})......,,.,,,,
Forensic Context

No forensic context available.