Basic Information

Symbol
hsa_CNTRL_0005100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CNTRL_0134
Host gene
CNTRL
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
9:123872815-123877478 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:121110537-121115200 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-516.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -568.33 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 574.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((((....((((((..((((((.....(((.((...(((((...((...(((((((((((((.....((((....(..((((....))))..)....(((((((((((......(((((((.(((((((((....((((.(((((.(((.(((((((.((((((.....(((((.......(((((((.((((.(((...((.(((((((......))))))).)).(((((.....)))))..((((((.((((((((((((((...........((((.(((((((.....(((.....)))..........(((..........)))...........((((((((((((((((..((((((.((((((((...))))))..(((((.((....)))))))....((((..((..((........))..)).))))((((.((.....))...))))((((((....))))))...)).))))))..))...(((((.((((.(((((((.((......))))))))).)))).)))))..(((((((((((.((.((....))...)).))))))))))))))))))))..)))))...(((((((((((((((((((...(((((((.(((((....((.((..(((((((...(((((.(((.(((((.((.((....)).)).))))).))).)))))))))))))).))(((((((.....(((.(((((....))))))))..))))))).....(((((....)))))(((((..............)))))..)))))...))))..)))...)))))))))))((((((((.....))))))))))))))))....)))))))))))...........)))))))))))))).))))))...((........)).))).)))).))))))).(((.(((((...((((..(((((.....((((((((...((((((.(((.............((((.(((.(((((..(((((((.((((.(((((......))))).....)))))))))))(((((((((((((.....((((((.......))))))..((((((((((((.....(((....((((((((((((...........(((((((((...((((((..(((((((((..((((((((((....((..((((((((.......((((((.(((....))).)))))).))))))))))..))))))))................................((((.(((((((.....))))))).)))).))..))))))))).((((..((..((((((.((((......(((((((((.....))))))))).....))))......(((((...........))))).............))))))..))....))))......((((.(((((.......(((((.....(((((((.((........))))).))))....))))))))))..)))).))))))...))))))))).))))))))))))..........))).....))))))))))))((((.(((((((((.((.......)).))))))..))).))))....)))))))))))))..........(((((......)))))...))))).))).))))..((((........))))(((((((..((((((((((..(((((.((((((........)))))).)))))...((((((((((((((((.......((((((((((..(((.((....)).))).)))))..(((((............)))))...............(((.(((.....((.(((((.((((........)))).))))))).....))))))..)))))......))).))))).)))).)))).....((.(((..((((..(((((...(((......))).))))).))))..))))))))))))))).)))))))))).))))))...))))))))..)))))..))))..)))))..)))..))))).....))))))))))))).))))))))...((((......))))..(((....))).))))..)))))))))..)))))))......))))).))))))....))))..))))))))).))))))...)))))...)).))))))))).))))))..........((((((....................)))))).......)))))))))(((((.......)))))..((((.((..((...........))...)).))))...............
Thermodynamic Ensemble Prediction
{,{{(((((((,,..((((((..((((((.....(((.((...(((((...((...(((((((((((((,{{{,,,(({{..{..((((....))))..}....(((((((((((.,....(((((((((((((((((....((({.{((((.(((.(((((((.((((((,....((((((((.,,.,{{(.{.{(...,((..((.((((({{{(((,...,}})))}....(((((.....)))))..((((((.((((((((((((((...........((((.(((((((....((((..((((((.....((((((((.........(((((((((((,,((,....,,,.,((({(({{.,.....,.((((((...))))))..,,|||..,..}}))))))},,,.(((((((.....,,,..,..(((((((((((((((.((.....})...))))))),..(((((.(((({{{((((((((,{{..((((((((.((((.{((((((.((......))))))))}.)))).)))),.((((((((((({.{{.((....,,...)),))))))))))))...))))..}}.,.)))}..))))))))))))))).....{({,{{,},,.......,{|{{{.(((((((..,(((((.(((.(((((.((.((....)).)).))))).))).)))))))))))},,.,,.}}})),.....))))))))....,}}.....)))))))..},,.{((((((....)))))))))))))))...)))))).........)))))))).....)).)))).))))...(((((((((.....)))))))))...........)))))))))))...........)))))))))))))).)))))).|,......{{{.(((..((((((((((((((..((,{{....(((((((((((.{((({(({({{,{,.{{{({((({{((((...........{(((.(({.(((((.(((((({{.((((,((({{......)))}}.,,,.|,},}}}}}}}{((((((((((({..,,.((((((.......)))))),|((((((((((((,{((((((,,..,{(((.(((((....{{{,...,}}},|,,))}}}|||((({{(({{((({{..,,{(((((((..{,{{..((((((((..,,,..((((((.,{,....})}.))))),.)))))))))},.))))))))......,},,,,......,|,,..,|,,....{(({.(((((({.....))))))).}}}}.,,,,})}}))))}}||||}.{(,.((({{{.{(({......(((((((((.....))))))))).....)))}......{({((...........})))).............))))))..}}....,,||,.,,..{((({..........{((((.....)).}}).....(((((((...((((({.|..(((({{.(((((.{.||....})).))))).))..)))).,.)))))).))))))}.}))))}.))}..}}))))))))))((((.(({((((((.((.......,),))))))..))).))))....,}))))))))}},....,,,,..{{{{{......)))))}}}))))).})).)))}.(((((........)))))..(((((((((,,,....,,))))))))}.......((((((((.,.........,.))))))))...)))))))}...,{{||||{,..,,{{({{{{{.|,{||,||.||,.(((((............)))))................,|,,||}},.,}}}||||(.((((........)))).}}},}}},....,}))))}.})))))}}.)))))))))))..}},.(((.......)))))..)))))}.((((..,,,,......|},.}}}}}|||||.}}},.,,,,,........)))))))).)))))}....,,,....))))).)).,)}))})))}.},.})),.,))))...,.))))))))))))).)))))))}...((((......))))..(((....))).))))..)))))))))),})))))).,..,.)))))))))}))}}}},,})}})))))))))}})))}}...)))))...)).})))))))).}))))}..........((((((..............,.,,..))))}),,,....}))))))))},,,........,,|||..((((.((..{{...........})...)).))))..............,
Forensic Context

No forensic context available.