Basic Information

Symbol
hsa_CNTRL_0005900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CNTRL_0177
Host gene
CNTRL
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:123875780-123907237 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:121113502-121144959 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-511.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -548.37 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 468.03
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(........)(((......((((...........(((((..((((((((...................))))))))......((((......))))....((((((.......(((((..(((.((............)).))).....))))).......))))))(((((....((((((.(((..((.....(((((................(((..((......))..))).((((((((((.................)))).........))))))..(((.((((((..(((.......((............))......)))..)))))).)))(((......))))))))....)).))).))))))............((((.....))))(((((....((((.(((((....((((...(((....((....)).........)))....))))....)))))......(((((...((((((......(.((((.(((((((((.(((..(((......)))...((((....))))((((..........(((((..........)))))..))))......)))...))).)))))).......((((((((...((((((((...(..((....))..)..))))......(((((((((((........(((((.(...((((..(((.....))).))))...).))))))))))))))))........(((((...((......)))))))((.(((...((((....(((((((((((.(((((.((((.........))))..)))))....((((....))))(((((((......((..((((((((((((((.......(((((............(((((((((...((........))..((((((.(((.(.(((((.(..(((..((((.(((((..((..(((.....(((.......)))(((((((((...)))))))))...)))..))..))))).......(((((((......)))))))...((((......)))).....(((.((....)))))((((((((.....)))))..))))))))))..)))))).)..))).))))))...((((..((((....))))..)).)).........))))))))).(((((...........)))))............))))).......)))))).....))))))))....(((((((((....)))))).)))((((((((((((.(.((.((....)))).).)))))))))))).((((...((((....((((.(((.(((........))).)))))))))))...)))).))......)))))))..(((((.(((....))).))))).)))))))..))))....))))...))).)).))))....)))))))).......)))).).....)))))).)))))..))))...)))))..((((((.......))))))...))))))))))...(((((((...........((((((.((((.((....(((((((..(((.((..((((((((.((((...)))).))))))))..))...)))........((((.....)))).((((.......(((((..(((((.........)))))....))))).......)))).(((((...)))))................(((((.(((.....))))))))(((..(((((((((((((........)))).............(((.(((((...((......))...))))).)))............)))))))))..))).......)))))))...)).)))).))))))..))))).))..((.((((((((((((((.((.((.....)).)).....(((.((....)).)))...(((((((.....((....)))))))))....))))))))...))))))..))....))))...)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{.,,{,...,,,,.....,((((...,....,(({{{.({{((((...((((..,.,..{{......((((((((..,({,.((((......))))..}.)),.))))).)))..))..,.,..)))))))},.}}.....,||,....||.}}.}}}...|||}|,{((((....{{{{((,{{{.,((..{(({,,,..................(({,{{,,,...||,.,,,.,{,,..((((.|..,............}}}}.........,})))|,.(((.((((({..{{{.......{{,......,,.............,..)))))).}))(((......)))})))}.,,.}),))),})))}}...,|.|,.,,,|||,.....,},,(((((....((((,({(((....((((..,((,.....|....{{{{{..,{{,||.....}}},..}},}))}.....}||||....,{{{{|.....|{||({||{|,...{{{{{,...{,({{,....,}...((((....)))){{{........,{.(((((..........))))).}),||..,.,{{.{,,|||.||||,,...||||||||||{||..,{,,({{({...{..{{....}}..|..}}}},.......({{{,{{{,.||||.{{(((((.(...{(({..(((.....))).))))...).))))))),.|||||||,..,,,,.{{{{{...{{......}})))))},,|||,,,||{{...,||||(((({,,.|||||||{||.........}}}},||)))}.,.,((((....)))}(((((((......((..((((((((((((((..,....(((((.....,......(((((((((.{.((........)).,((((((.(((.,.(((((.(..(((..{{({.(((((..((,,(({.....{{{.......}}}(((((((((...)))))))))...)))..)),.))))).......(((((((......)))))))...,{((......}})).....{{{.{,....,},,,((((((((.....))))}},)))},,,)))..)))))).}..))).))))))...{{{{.,((((,...}}}}..}}.}}..,,,,,,.))))))))).(((((...........)))))......,.....))))).......)))))).....))))))))....(((((((((....)))))).)))((((((((((((.{.(,,((....)))).}.)))))))))))).((((...((((....((({{(((.(((........))).)))))))))))...)))).))......)))))))..{((((.(({....})).))))}.}||||}},||||,...,))})...))}.,..,{|....,}}.,,{{{......)))}........,))}))})))))},))))...)))))..((((((.......))))))...))))),),}},,.(((((((...........((((((.((((.((....(((((((..,{{.{{..((((((((.((((...)))).))))))))..}}...}}}........((((.....)))).((((.......(((((..((((({....}}},,,,}},,..))))).......)))).(((((...))))).,..............((((,,(((.....))))))))(((..(((((((((((((........)))}.............(((.(((((...{{......))...))))).)))...,,.......)))))))))..)))....,,.)))))))...)).)))).))))))..))))).))..((.((((((((((((((.((.({,...|}}.)).....(((.((....)).)))...(((((({....,((....)))))))))....))))))))...))))))..))....}))),.,)},
Forensic Context

No forensic context available.