Basic Information

Symbol
hsa_ABCA1_0005700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCA1_0050
Host gene
ABCA1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:107571747-107576512 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:104809466-104814231 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-141.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -152.56 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 75.80
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.(((((((....((((..(((((((((..(.(.(((((((((.(((((((((((.........))))))(((.((....(((((...((((((((........(((...((((..(((.((....)))))..)))).))).((((((((((((((.(((.(.(((.(((((.(((((...........))))).))))).)))).))).)).)))).))..))))))..))))))))....)))))....)))))...........))))).))))))))).))..)))).........))))).))))........))))))))))))((((.((((....))))..)))).(((((........))))).....((((....))))((((((((((.(.((((..(..(((..................)))..)..)))))))))))))...))...))((..((....))....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,(((({{(((((((...,((((..(((((((((..,.(.(((((((((.(((((.,.....(((((((((((.{.,,,.,(((((,.((.....(((((((.........)))))))..},.}).)))..,,}))))))))})))).,((((({(((((((.(((.,.(((,(((((.(((((...........))))).))))).)))).))).)).)))).)}..)))))|(((((((.((((({....)))))))))....))))}.,.))))).))))))))).),..))))..,....,.))))).)))).,......,)))))))))))((((.((({....})))..)))).(((((........))))).....{{((,,..}}})|,((((((((.(,{(((..,..(((..................)))..,.,))))})))))))).,.},.,.,}((,.((....))..},),
Forensic Context

No forensic context available.