Basic Information

Symbol
hsa_CNTRL_0006200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CNTRL_0128
Host gene
CNTRL
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
9:123877369-123908619 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:121115091-121146341 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-567.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -605.29 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 497.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((....(((((.((((..((((.................))))..............((((((.(((..(((((((.....((((((......................))))))(((.(((......))).)))((((...((((((((.....))).)))))))))..)))))).)..)))..))))))((((((((..(((...((((..........(((((.((((.((...........)).)))).....)))))......))))...))).)))))))).............(((......)))...((((....))))((((..........(((((..........)))))..))))......)))).)))))((((((.......((((((((...((((((((...(..((....))..)..))))......(((((((((((........(((((.(...((((..(((.....))).))))...).))))))))))))))))........(((((...((......)))))))((.(((...((((....(((((((((((.(((((.((((.........))))..)))))....((((....))))(((((((......((..((((((((((((((.......(((((............(((((((((...((........))..((((((.(((.(.(((((.(..(((..((((.(((((..((..(((.....(((.......)))(((((((((...)))))))))...)))..))..))))).......(((((((......)))))))...((((......)))).....(((.((....)))))((((((((.....)))))..))))))))))..)))))).)..))).))))))...((((..((((....))))..)).)).........))))))))).(((((...........)))))............))))).......)))))).....))))))))....(((((((((....)))))).)))((((((((((((.(.((.((....)))).).)))))))))))).((((...((((....((((.(((.(((........))).)))))))))))...)))).))......)))))))..(((((.(((....))).))))).)))))))..))))....))))...))).)).))))....)))))))).......)))))).......(((.((((.((.((.....)).))..((((((.......))))))))))))))))).....(((((((...........((((((.((((.((....(((((((..(((.((..((((((((.((((...)))).))))))))..))...)))........((((.....)))).((((.......(((((..(((((.........)))))....))))).......)))).(((((...)))))................(((((.(((.....))))))))(((..(((((((((((((........)))).............(((.(((((...((......))...))))).)))............)))))))))..))).......)))))))...)).)))).))))))..))))).))..((.((((((((((((((.((.((.....)).)).....(((.((....)).)))...(((((((.....((....)))))))))....))))))))...))))))..))....((((((((((((((.(((((............))))).((((..((((((....))).)))..))))........))))))).....(((((((..((.....((.(((....(((((....)))))..))).)).....(((((...)))))......((((((((((....(((((...((((...........))))))))))))))))))).((((......(((((...((((((.(((((((((.......((.((((....(((((.....)))))......)).)).))......))))..))))).))))))...)))))..))))(((((((...)))))))))..)))))))..)))))))..............
Thermodynamic Ensemble Prediction
......,((..((.,(({..((((.,,.,,............{{{,,.......}}}}}.,,(((.((({{{,,{{{......,{{,.,....,,................)))))).||}(((......))).}|||{{{.,,{(((((((.....))).)))))}))}},,,,,||..{((((....{(({,{{{{{....((((..,((,.....|,...{{{{{..,{{,||.....,},,..}},}})}.....}||||....,{{{{|.....|{|{((||{|,...{{{{{,...{,({{,....,}...((((....)))){{{........,{.(((((..........))))).}),||..,.,{{.{,,|||.||||}}...||||||||||{||..,{,{({{({...{..{{....}}..|..}}}},.....,,({{{,{{{,.||||.{{(((((.(...{(({..(((.....))).))))...).))))))),,|||||||,..,,,,.{{{{{...{{......}})))))},.{|{.,,||{{...,||||(((({{,.|||||||{{{.........}}}},||)))).,.,{(((....)))}(((((((......((..((((((((((((((..,....(((((.....,......(((((((((.{.((........)).,((((((.(((.,.(((((.(..(((..{{({.(((((..((,,(({.....{{{.......}}}(((((((((...)))))))))...)))..)),.))))).......(((((((......)))))))...,{((......}})).....{{{.{,....,},,,((((((((.....))))}},)))},,,)))..)))))).}..))).))))))...{{{{.,((((,...}}}}..}}.}}..,,,,,,.))))))))).(((((...........)))))......,.....))))).......)))))).....))))))))....(((((((((....)))))).)))((((((((((((.{.(,{((....)))).}.)))))))))))).((((...((((....((({{(((.(((........))).)))))))))))...)))).))......)))))))..{((((.(({....})).))))}.}))))}}}|,||,...,))))...))}.,..,||....,}}.,,{{{......)))}........,))}))})))))},))))...)))))..((((((.......)))))))))).,)}},,}}.},(((((((...........((((((.((((.((....(((((((..,{{.{{..((((((((.((((...)))).))))))))..}}...}}}........((((.....)))).((((.......(((((..((((({....}}},,,,}},,..))))).......)))).(((((...)))))................((((,,(((.....))))))))(((..(((((((((((((........)))).............(((.(((((...{{......))...))))).)))...,,.......)))))))))..)))....,,.)))))))...)).)))).))))))..))))).))..((.((((((((((((((.((.({,...|||.}}.....(((.((....)).)))...(((((({....,((....)))))))))....))))))))...))))))..))....((((((((((((((.{(((,.....|||....|||,|.((((..((((((....))).)))..)))).,..,,,.)))))))...,.(((((((..((.....{(,{((....(((((....})))}..))}.}}.,.{,(({((.,.|||},...{{{{{,,,,}|||}....,,||||,|,{|...,,.,}|||||||,,.}))))))))},,.{(({......(((((...((((((.(((((((((.......((.((((....(((({.....}))))..,...)).)).))......))))..))))).))))))...)))))..))),{{(((({...}))))))))..))))))),,)))))))...,,,.,......
Forensic Context

No forensic context available.