Basic Information

Symbol
hsa_CNTRL_0010000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CNTRL_0111
Host gene
CNTRL
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:123903659-123920387 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:121141381-121158109 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-627.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -668.60 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 604.44
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

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