Basic Information

Symbol
hsa_chr9_0138900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CNTRL_0106
Host gene
CNTRL
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
9:123906496-123907287 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:121144218-121145009 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-224.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -237.67 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 154.07
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..(((....))).......(((.(((((..((........))..))))).)))...(((((((((.(((((....((((((((...(((((((.((.......)).)))))))...(((.((....)).))).....((.((.....)).)))))))))).)))))...))).)))))).(((((.((((((.(.(((......)))).)))))).)))))...)))((...((((((((((((((.....(((((((..((((.(((((.(((((........))))).)).((((.....((((.(((((((((.((....((((((.(((.......))))))))).....)).)))))).)))..))))....)))).............................((((.(((((((..(((.((((((((((((.(((.(((((((((((((((..(((...(((((............)))))....)))(((((..(((................)))..)).)))((((((....(((((......))))).))))))....))))).)))))))))))))...((((((((.......))))))))(((((...(((((.((((((((((.....((((..((((((.....((((.......))))))))))))))))))))))))))))))))))...))))))))).)))..)))..)).))))).)).))............)))))))))))))))))))))).))))))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({,.{{,....,}}.......(((.(((((..((........))..))))).)))...((((((((({(((((....((((((((...(((((((.((.......)).)))))))...(((.((....)).))).....((.{{.....}}.))}))))))).))))).,.))).)))))).(((((.((((((.(.(((......)))).)))))).)))))...)))((...((((((((((((({....,(((((((..((((.{{{((,(((((........))))).}}.,(((.{{,,{{....{(,((((,.,,....(((((({(,,.}}}}}})),,,})}},..,,))})}))),..,{((((,{.(((({.{{{.....},,))))}.,.))))}......({((.(((((((..(((.((((((((((((.(((.(((((((((((((((..,,{...(((((............)))))..,,|}|(((((..(((...{{.....,,....)))..)),,))((((((....(((((......))))).)))))).}..)))))}))))))))))))}...((((((((.......)))))))){((({...{{{{||(((((({({{.....{|||,,|{{{{{.,,,,((((,,.....}))))))))))}))}))))))))))))))}}}}}...))))))))).)))..)))..)),})))).)).))............)))))))))))))))))))))).))))))..))
Forensic Context

No forensic context available.