Basic Information
Symbol
hsa_ACTN4_0007500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ACTN4_0035
Host gene
ACTN4
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
19:39214471-39215614
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
19:38723831-38724974
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-371.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-385.86 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
191.33
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..(((((((((....)))))).......))).)(((((..........((((((.....(((((((((...((((((..(((....................)))...))))))..((((((((..(....)..))))))))...(((......))).((.((.((.((((((((.....(((((((.(((((((.(((((...)))))))...))))).)))))))......((.((((.(((.((((((..(((((((....(((........)))..(((((.(((...))).))))).((.(..(((.(((((((((.(((....)))))))...))))).)))..).))............((((.(((((((....(((.((((.(((((.((((((((........((((.....))))..(((((((..((((((.((.....)).))).(((((((...)))).)))..((.....)).........)))..)))))))........(((.....))).....))))))))..(((....))).....))))).)))))))....)))..)))).)))).)))))))))))))))).....))))))...)))))))).)).))))..(((.(((((((........)))).)))))))).))))))).....(((.(((.(((((((..........))))).))))).)))((((.((((((.(((((((((.((....))))).....(..(((((((((.(((.(..(((((((.(((((((.(((...)))...)))))))..)).)))))..)))).........................((.(((((((((.(((((((((((.........).)))))).....)).)).)))))))).).)).)))))))))..).))))).).)))))).)))).)))))).......)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..({{({((({....}}}))|.,....})}}.)(((((.,........((((((.....((((((({{...((((((..{{{....................,}}...))))))..((((((((.,{....)..))))))))...(((......))}.({,((.(({(((((({,.,...(((((((.(((((((.(((((...)))))))...))))).)))))))......{(.((((.(({.((((((..(((((((...,({{....,,..|||..{{(((.({(,,.|}|,|}||}.((.(..(((.(((((((((.(((....)))))))...))))).)))..).))..,,...,,..,{(({,((((|{{....(((.((((.(((((.((((((({..,,,...((((.....))))..(({(({(..((((((.((.....)).))),{||{{{(,,,|}}|.||}{,((..,,.||.,,......}))..))))})}|},.|||,{||..,..)))..,,,))))))))..(((,...}}}.....))))).)))))))...,))),.))}}.}))).)))))))))))))),......))))))..})))))))),)},))))..({(((((((((........)))).))))))}).))))))).....{((.(((.(((((((..........))))).))))).)))((((.((((((.(((((((((.((...|||))}..,,,|,,(((((((((.(((.(..((((({{.(((((((.(({...}))...)))))))..}}.)))))..)))).........................((.(((((((((.((((((((((,..,....,,,.)))))).....)).)).)))))))).).)).)))))))))..}.))))).).)))))).)))).)))))).......)))))
Forensic Context
No forensic context available.