Basic Information
Symbol
hsa_chr19_0223400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ACTN4_0023
Host gene
ACTN4
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
19:39214932-39220170
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
19:38724292-38729530
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-444.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-461.41 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
363.07
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((........))))))(((.(((((((((...((((((.....)))))).(((((((((((...(((((((((((.((((.((((((.(((...(.(((.(((((((.(.((((((.((........)).))))))).)))))))))).)....))).)))))).))))((((.((.((....)))).)))).....(((((((((.((((((((((((.((..(((((((....)))))))..)))))...)))))))))(((((.((((.(.(((.(((.((((...))))..))).)))((((((.(((....)))))))))........).)))))))))..((((....))))(((((((.(((((.(((((.(((....(.((.(((((....))))).)))...))))))))..)))))..)))))))))))))))).((((.((........))))))....)))))))))))((((....(((....((((((((....((((((..((....)).(((.((((((.(.((((.(((((.((.(((((((((((.(((......))).)))).)).))))).)).))))).)))).).)))))).)))...((((.(((((.((((((((....)))))).)).)))))...))))(((..(((..(((((((((((((..(((((.((....)).)))))..)))))))..))))))...)))..)))....))))))..))))))))))))))).....))).))))))))))))))))).)))(((((..(.((.(((((((((...(((...)))...)))))..))))..)))..)))))(((((((((.(.....).)))).))))))))(.(((.(((((((.(((((((((..(((((((.(((...(((.(.((...(((....))))).).)))....))).)))))))..........)))))))))))))))).))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((,...,,..|||}||(({,((,{(((((,,.((((((.....)))))).(((((((((({...((((((((((|.{{((,{{||{{|||||||||{{||(({((((,|.{{((((,((,,,,,,,,}|,||}||||.}||||}},||{{{,{{,||{||||||{||||(({({((.((|,,,||}|,|}}}.....|||{||(((.(((((((((({{,((..(((((((....)))))))..))))}...)))))))))}},.{|(({{...{{,.{{{.(({(,{.||||,{|}},}}|((((({,(((....)))))))))}{{{{{......))))),,.,||||....))))|{{{{{|,|||{|,|||||,|||,,.}|}||,{||{|..},)))))}),..,,))}))))}}})))))},}}}}}||}}}}))))}}||||},|}}}}}}..))|||,|,||}}}))))))))(({(,.{,({,..,,{(((((({.{{,(({{((..((....}}.(((.((((((.(.((({.(((((.{(.((((((((((({((({...}}))),}))).)),,)))).)).))))).}))).).)))))).))),,,{(((.(((((.((((((((....)))))).)).)))))...}}||(((..(((..(((((((((((((..(((((.((....)).)))))..)))))))..))))))...)))..))),||,|}|}}},.})}))}})}}))))).},}}})).)))))))))))))||,|({|{(...,}}|}}}.||,,,{{{|}},|||,..})),,,)}})),,||}||,.....,,,})|||||((({,(,...,),))))}))))))))(.(((.(((((((.((((((((({{((({{{{,||(|,{(((,{{{,...))|)})}||,},,)},)),,,.})).)))))))..},..,...))))))))}))))))).))).)
Forensic Context
No forensic context available.