Basic Information

Symbol
hsa_DENND2A_0005400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-DENND2A_0074
Host gene
DENND2A
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:140269445-140302342 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:140569645-140602542 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-579.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -609.65 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 387.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((.((((((((((....(((((((((...((.(((...)))..))...))))))))))).)))))..))).))..((..((..((((..((((((....)))))).((((.....((((..(.((((((............(((((....)))))(((((((..(((.(((((((.(..((.(((((....).)))).))(((((((...((((.((...)).)))).....(((((.((((((((.....(((.......)))....((((...........)))).......))).)))))))))).....((((.(((...(((((((.....))))))).)))(((((.((((.......)))))))))))))...((((((.(((((.((.(((((.((((....))))..)))))(((((.......(((...(((((.(((((....(..(((((((((((((((((.....((.((((.(...(.(((((((..((....((((..((((((........(((..((((...((((......))))..))))))).((((((((..(((((...)))))..((((.((((((.......(((((((((((.((((...((((((......((((..((((.(((..((((.((((.(((.(((((((....)))))..)).((((........))))....((((((((((....))).)).))))).))).)))).))))..))))))).....))))..(((((........)))))(((((.....))))).))))))....(((..(((((....((((..(((...)))..))))...))))).)))..(((((.(((....))).)))))..((((((.....((((..(((((((((....................)))))))))......)))).....))))))...)).))))))).))))))........)))))).)))).))))))))((((...(((.......)))...)))).)))))))))).))))))))))).))))))))))))))......)).)))))))..)......((((((((..(((........))).)).....))))))..(((((((..((((((......(((..(((((((((((((....))).)))).)))))))))....))))))....)))))))(((((((.((((((((((..((((.((((....)))).))))...))))...)))))).....(((.....(((.((.(((.(.....).))).))))))))......))))))).......))))))))))..))))))))((((((((.(((.......(((.(((((..(((......(((.((((((...((......)))))))).))).....)))))))))))....(((....))).)))))))))))..((((......))))......))))))))))))))))))))...)))))))))))(((((((..((((((....))).........)))..))))))).......)))))))(((((((.....))))))).....))))))..)..)))).......)))).......(((.(((........))).))).))))..))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,({(((((((.,({{..((({((,,,..,|..||}....))}.))}})))),)})|{,,.{((({{((((.((..,,..||}}|}}}..((((((....)))))),((((.....((((,.{.((((((.....,.,,...(((({....}}))){((((((.|{{{.(((((((.{.,((.(((((....),}))).))((((((,.,.,(((.((...}).))))}....(((((.((((((((.....(((.......)))....((((...........)))).......)))},))))))))).....{{{{.{((...(((((((.....))))))).))}(((((.((({.......)))))))))))))..,((((((.(((((.((.{((((,((({,.,.||||{{}}},,{((((.......(((...((((,,(((((....{..(((((((((((((((({....,((.((((.{...(.(((((({.,((....((((..((((({.{......(((..((((...((((......))))..))))))).((((((((..(((({...}))))..((((.((((((.......(((((((((((.(({(((((.{,((.,{...}},}}.)..))))|,{(((..,((((,,(((((((((..,,|}}},,.{{{((((((({{{{{((((.,{.((((((((((....))).)).))))),,|,,..((((((.,.....,.)))))).})))})|||{...,,}}}.,((.(((((.....))))))),))))}..,||{||{|{||..,}||||.,|||,,,)}),,))))...)))}}.}}}..|,|||}}}}.}}}),}.,))))..((((((.....((((.{{((((((({..............,.....}))))))))......)))).....))))))......))))))),,)))))........)))))).)))).)))))))){(((..,({{.......)))...))))})))))))))).))))))))))}.)))))))))))))}.....,)),}))))))..}......(((((({(..(((........))).}}.....))))))..(((((((..((((((......(((..((((((,((((((....))).)))).)))))))))....))))))....)))))))(((((((.(((((({(({,,((((.((((....)))).))))...)))},}.)))))).....,{(|,...(((.((.(((.(.....).))).)))))})}...,..))))))).......)))))))))),.)))))))}((((((((.(((.,,,{,.((,{(((({..{((......(((.((((((,,.{,......,}}))))).))).....))}))))))))....,,|..,}})).))))))))))).,||||},,,,.)))}...,,,))))))))))))))))))))..,,)))))))},{(((((((..((((({....|}}........,)))..)))))))}...,,.))))))|(((((((.....))))))),....))))))..},.)))).......)))),|..{,,(((.(((........))).)))..))).)))}.))
Forensic Context

No forensic context available.