Basic Information

Symbol
hsa_DENND4C_0001200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-DENND4C_0086
Host gene
DENND4C
Type of circRNA
Intron-Exon
Location (GRCh37)
9:19274339-19276477 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:19274341-19276479 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-640.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -676.27 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 465.97
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((((((...((((.(.......).)))))))..))))))(((((((((....(((((.(((.(((((.......(((((((((((((......(((....)))......)))))))).................(((.((((((((..(((.(((.....))))))....))).)))))..))).((((..(((((.(((.(((((((...))).)))))))((((....))))(((((.((((((((((((((((.(.((((..(((..(((((.(((((((((..((...(((((..............(((((((.....)))))))...((((.((((...((((((((..((((..........)))))))).))))...)))).)))).((((((((((.(((((.....))))).)))......))))))))))))...))..))))))))).))))).....)))..)))).)((((.((......)).)))).............(((((((.......)))))))((((.(((((....(((((((((((.((....)).))))))))))).))))))))).....(((((((((((((((....(((.......)))......)))))....))))))))))(((((((...))))))))))))))))))).)))).)))))..((.(((((......(((......)))...))))).))..(((.......)))((((((..(....)..))))))......))))).))))..((((((((..(((((((.(((((....((.(((...((((.((((((((((((((((((((((((((......)))).....(((((((...(((...((....))...)))...))))))).((((((.(((..(((.((((((..................................((((((((((...))))))))))..((((.((((..(((((((.((...)).)).)))))....))))))))...(((((.(((.....)))..))))).............)))))).)))...))).)))))))))).)))))))))))))....(((((...............))))).((((..((...(((..((((((((((.(((((.((((((....))))))))))).)))).........))))))..))).))..)))).((((.....((((((....))))))....))))(((..(((((((((..((((..(((((((((....)))))))))..))))..))).))))))...))).......(((........))).)))))...))))..))).)).......))))).))))))))))))))).((.((((((((((((((....(((((.......)))))....((......))))))))))))...)))).))...........)))))(((((((....(((((((....)).))).))..)))))))))))).)))..)))))))))))...(((((((((((((..(((((.(((((((.....)))).))).)))))..)))).))))).))))..............((((((((.((.((....)).)).))))))))(((((((.(.(((((((((((((((((((..(((((((((((........)))))))..))))..))).)))).((((..........))))((((((((....)))))))).(((((((((....(((...(((((((......................)))))))...))).(((((((.((((((....))))))((((.(((((.....))).)).)))).)))))))...................)))))))))(((((.((((........)))).))...))))))))))))............((((......))))(((....))).....))).).)))))))..(((((.((.....((((....))))..))))))).(((((..((((......((((((((((........))))))))))..........)))).)))))..)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.(((((((..,((((((.....|||,})}})}}..))))))(({((((((....(((((.(((.((((({{(....|||||((((((((......(((....)))......))))))))....,.,,......,,,{{{,(((((,{,..{({.({{.....}}}}))....,}}.)))))..}}}.((((..{((((.({(,(((((({...})).))))))}...,,{|{|||,(((((.((((((((((((((((.,.,{{{..{{{..(((((.(((((((((..((,,,({{((,(({(((,.,{{{.(((((((.....)))))))...((((.((((...((((,,({..((((..........)))).)),.))))...)))).)))).,,,||||(((.(((((.....))))).)))}}}}}},)),}})))))}...}}..))))))))).))))).....|||,.||}}||,{{{.{{,.,,..}}.}}},............,(((((.,.}}}}|{((((((((((,,(((((....(((((((((((.((....)).))))))))))).))))))))).....(((((((((((((((....(((.......)))......)))))....))))))))))..)))))))}},,,,,.}))))))))))).)))).)))))..((.(((((,.....(((......)))...}}}||,}}..{{{.....,,})}{|{|||,,{...,)..)))))),.....|||}}.}}})..((((((((..(((((({.(((((....((.(((...((((.((((((((((((((((((((((((((......)))).....(((((((...(((.,.((....))...)))...))))))).((((((.(((..(((.((((((..................................((((((((((...))))))))))..((((.((((..(((((((.({...}).)).)))))....))))))))...(((((.(((.....)))..))))).,......},}..)))))).)))...))).)))))))))).))))))))))))).....,,,,...............|||||.((((..((.,.(((..((((((((((.((((,{((((((....))))))))))).)))}........,))))))..))).))..)))).((((.,...((((((....))))))....))))(((..(((((((((..((((..(((((((((....)))))))))..))))..))).))))))...)))...,,,,|||.....,..}}).)))))...))))..))).)}.......))))).})))))))))))))).|{,|{{{((((((((((.....,,,,.....,,}},|||||.,{}},,,.)}))))))))))...}))),}}........,.,},,,}(((((((....(({((((....)))),).))..)))))))))))).)))..)))))))))))...(((((((((((((..(((((.(((((((.....))))},)).)))))..)))))})))).))))..............((((((((.((.((....)).)).))))))))(((((((.{.(((((((((((({((((({..{((({((({((,,,,.,{,|||||||,,}}}},,))).}|||{(((,.....,,,},))}},,((((((,,,.,}))))))}|||||||{|,,,,{((...(((((((......................)))))))...))).(((((((.((((((....))))))((((.(((((.....))).)).)))).))))))).....,,......,,,.,,))))}}}}}|||||.((((......,.)))).,,...}},))))))))).........,,,((((......)))),{|,,,.}}}.....))).}.)))))))..(((((.((.,.,.{(((....))))}.))))))).(((((..{(((...,..((((((((((........))))))))))..........)))).)))))..)))
Forensic Context

No forensic context available.