Basic Information
Symbol
hsa_DENND4C_0003500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-DENND4C_0214
Host gene
DENND4C
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:19276219-19316837
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:19276221-19316839
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-421.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-458.54 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
431.44
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.....))).(((((..(((((((.....((((((..(((.....)))...........((((........))))....(((((.((.((((.....((((....((((((((........((((.(((((((....)))))........)).)))).))))).)))....))))...)))))))))))............((((((((((........))))))))))..........((((.((...(((((((((.....(((((((((((...((......))((((((((.(((((((.(((.......))).)))))))........((((((((((((...)))).(((.....))).............(((((.((.....))..))))).(((((......(((((((.....((.((((((.((((((....))))))(((((......)))))..........((((((((((.(((((((......(((((.((((((((((((((...((((((.(.(((.((((((.((.(((.((((...((((....))))...)))).))).))))))))..))).)))))))..((((...)))).......(((((((((.((((...........))))..)))...))))))..(((....))))))))))))))........))))))))....)))))))))))).)))))....))))))))..))))))).(((((.((((((((((.....)))))))))).)))))..((((..((.......)).))))....((....))..))))).))))))))(((.((((((((....((((.........))))......(((((((....))))))).))))).))).)))((((....))))....(((((....))))).(((((..((((.......))))..)))))))))))))........(((((......)))))...................))))))))))).((..((((.(((((..((((((((((((((.(((....(.((((((((...(((..((((((((.............((((((((((((((((...((((((...))))))......)))(.(((((((...(((((.((....(((((((..........)))))))......)).)))))..))))))))((((((((((....)))))))))).(((((...))))).......)))))))).)))))(((.................))).........))))))))..))).)))))))).)......))).))))))))).......)))))..))))).))))..))............((((((.((((........((((((((.((((((.......((....)).......))))))....(((((...))))).........((((.............))))..........))))))))..((((.((((.((((........)))).)))).))))..)))).)))))))))))))))))))))..)))))).....))))))))))))...)))(((((((((((...((((((((((....))).)))).)))..))))))).....((((((.....))))))(((((.((((((((.((((...........))))....))).)))))....))))).....))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((,..,,|,}.(((((..(((((((.....{(({{{..,{{,{{,.{||.,...|{|,,,((((......|.)))}.,,.(((((.{{.((((.....((((....((((((((....{,..({{,.{{{,||,.||{||,||......,,,}.,}}).)))))}}))....))))...))))}})))))..,{{{,,,,..((((((((((........))))))))))..........{{{(.((,..{({((((((,,...{{{(((({{{(...{{,{....,,{(((({{{,{{{{|||}|||||...,,}},.|||||||{,{{,...(((((((,,{({...,,,},|{,.....},..............{((({{({.....))..})))}.(((((......{{(((((.,,,,{{,{{((({,((((((....)))))}(((((......)))))..........((((((((((.(((((((......(((((,((((((((((((((,..,{((((.(.{{(.{(((({.,,.(((.((((...((((....))))...)))).))).,,,)))))..))).}))))|{{((((..{{{|||.......,,,.{{||,,||{{.,,.,,))}.,)}}}.{{{{{...)))))..,{,....}}))))))))))))........})})))))....)))))))))))))))}))...,)})))}|},,)))))}}.(((((.((((((((((.....)))))))))).)))))..{||,}||,..,},,.,},)))}....((....))..))))),))))))))(((.((((((((....((((.........))))......(((((({....})))))).))))).))).))){{(({{..{||{{{{{((({,.,.,||||..,(({{{{{{{|,,{.,{{.(((,,,(({.....,}},.....,,.,||||.,,.,.,))))||,,|,{{{{{{{{{{{{.,}},,,,,}},.((..((((.(((((..((((((((((((((.(((....(.((((((((...({{..((((((((.............(((((((((((({{({.,.((((((...}))))).|....}}|{.(((((((...(((((.((.,..(((((((.,,...,,..)))))))......)).)))))..)))))))}(((((({(({....}))))))))).(((({...})))).......,))))))).))))).,,.,.......,........}}.........))))))))..))).)))))))).,......})}.))))))))).......)))))..))))).))))..))...........}|||||..||||},.,,...|||||||{.{{{|||...}}}.{{,,,})),...,}}))}))}..}}|||||,..}))),....|||..((((.,........,}.)))),,........}}))}))}..{(((.((((.((((........)))).)))).)))},,))))|||,},}}}})))))))))))).,))))))..,,.))))))))))))...))){((((((((((...,(({((((({....})},)))).}),..)))))))}},..((((((.....)))))}{{|||.{(((((((.((((...........))))....))).))))}....)}})),....}}))
Forensic Context
No forensic context available.