Basic Information

Symbol
hsa_DENND4C_0005100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-DENND4C_0161
Host gene
DENND4C
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:19286767-19305523 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:19286769-19305525 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-285.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -311.81 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 221.53
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((....(((((((((((...((......))((((((((.(((((((.(((.......))).)))))))........((((((((((((...)))).(((.....))).............(((((.((.....))..))))).(((((......(((((((.....((.((((((.((((((....))))))(((((......)))))..........((((((((((.(((((((......(((((.((((((((((((((...((((((.(.(((.((((((.((.(((.((((...((((....))))...)))).))).))))))))..))).)))))))..((((...)))).......(((((((((.((((...........))))..)))...))))))..(((....))))))))))))))........))))))))....)))))))))))).)))))....))))))))..))))))).(((((.((((((((((.....)))))))))).)))))..((((..((.......)).))))....((....))..))))).))))))))(((.((((((((....((((.........))))......(((((((....))))))).))))).))).)))((((....))))....(((((....))))).(((((..((((.......))))..)))))))))))))........(((((......)))))...................))))))))))).((..((((.(((((..((((((((((((((.(((....(.((((((((...(((..((((((((.............((((((((((((((((...((((((...))))))......)))(.(((((((...(((((.((....(((((((..........)))))))......)).)))))..))))))))((((((((((....)))))))))).(((((...))))).......)))))))).)))))(((.................))).........))))))))..))).)))))))).)......))).))))))))).......)))))..))))).))))..)).....(((...(((((.....)))))....)))....)))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
,((((,,,.(((((((((((...{{......,,((((((((((((((((.(((.......))).))))))}{{{{....((((((({,(((...,,,}.{,,.....|,..............((((({({.....))..))))).(((((......{((((((.....((.({((({.((({({....))))),(((((......)))))..........((((((((((.(((((((......(((((,((((((((((((((,..,{((((.(.{{(.{(((({.,,.(((.((((...((((....))))...)))).))).,,,)))))..))).}))))|{{((((..{{{|||.......,,,.{{||,,||{{.,,.,,))}.,)}}}.{{{{{...)))))..,{,....}}))))))))))))........})})))))....))))))))))))))))))...,)}))))}}..))))))}.(((((.((((((((((.....)))))))))).)))))..{{{,|||,...,,}.,,,))),....((....))..))))).))))))))(((.((((((((....((((.........))))......(((((({....})))))).))))).))).))){{{{....}|}}....{((((....}))}}.(({,....||}.,,,{{{.||{...|||.....,,,},,...}}}.))}}.))}),.})))))))},..,..........))))))))))).((..((((.(((((..((((((((((((((.(((....(.((((((((...({{..((((((((.............(((((((((((({{({.,.((((((...}))))).|....}}|{.(((((((...(((((.((.,..(((((((.,,...,,..)))))))......)).)))))..)))))))}(((((({(({....}))))))))).(((({...})))).......,))))))).))))).,,.,.......,........}}.........))))))))..))).)))))))).,......})}.))))))))).......)))))..))))).))))..)).....{{{...(((((.....)))))....))),,,.)))),|,,...}}
Forensic Context

No forensic context available.