Basic Information

Symbol
hsa_chr9_0336600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-DENND4C_0255
Host gene
DENND4C
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
9:19287872-19288627 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:19287874-19288629 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-177.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -193.61 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 206.82
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((........)))...(((.(((....))).)))..........((((((((((.....((((....(((((((...((((.(((((((((((...)))))..)))))).)))).)))))))......)))).........((((((...))))))..(((.((((...)))).))).(((((....(((...((.((........)).))..)))....))))).......((((((((((((((((((.(((((....((((..((...))..)))).....))))).)))..))).(((........))).....(((((((((((((.((((...((((((.((((((..(((((.(((((((....(((.....)))))))))).)))..))..)))))).))))))))))..)))))).....)).)))))...................))))))))))))..((((((...))))))..))))))))))...(((((...((((((((...........(((((.((........)))))))..........)))))))).))))).........(((((..(((...(((((.((((((....))).....((((((....))))))......(((((((((.((....((((....))))..))))).))).))).((((...))))...))).)))))...)))..))))).......)))((((((.((...))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((({{........}},...{,{.(((....))),})}....,,{{..{{,{{((({{.,{{.{(((....{((((((,{{(((,{(({((,(((((...)))))..}}||||{||}}.}}}}}}}....,,)))}.,,,.....((((((...))))))..(((.((((...)))).))).(((((....(((...,{.((........}}.}}..)))....))))).......((({{{{{{{{{(({(((.(((((....((((..({...})..)))).....))))).)}}.,})),{{{,,,,,{{{|{......((((({((((((({((((...((((((.((((((..(((((.(((((((...,((,...,,),,))))))).}},.}))).)))))).)))))))))))})))))).....}).)))))...........,{{,|{,,}}}}))))))))..((((({...})))))..}},,,}))}}...,,,{|...|||||{||,,,........{{{{|||,........})))))},,,,,,.,,,)))}}})),})))}...,.....{{{|{,.|||..,((((({((({((,,{{|{{{{{..((((({....,))))).,,,,.{||||||{(.((....((((....))))..)}))},)}}}|}}.{|||...})))...,}},))))}...}}}..,,,,,......})))((((((.||...,)))))))
Forensic Context

No forensic context available.