Basic Information

Symbol
hsa_DENND4C_0007300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-DENND4C_0245
Host gene
DENND4C
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
9:19289089-19300329 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:19289091-19300331 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-576.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -621.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 438.26
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((.............)))...(((((((((..((((((((((((.((((((((((((.((((....(((((((....(((((.(((((((......((((((..(((((.((((((((.......(((((((((((...(((......)))........((((((((.....)))))))).....(((......)))......((((((................))))))...(((((((....)))))))....((((((((.....)))))).)))))))))))))....((((...))))...((((((((.(....................).)))))))).........(((((....))))).....(((((...(((((...)))))...)))))..(((.....)))........((((((((..........))))))))((((((((((......))))).))))).....(((((((((((((((((((((((((.....))))))..(((((((.(((...)))...))))))).....(((((.......((((((((((((((((((....((((((((((((....)))))..)))...((((((....))))))...(((((((.((.....((((..(((((((....((((..(((((((..............)))))))))))..)))))))....))))....)).))))))).........((((((((.(((((...((((.(.((........)).)))))...))...)))))))))))))))...))).))))))))))))))).......)))))(((.((((.((((((((((.....((((((....((((((((...((((.((((((((......((.((((((......((((...(((..((((.((((((((........))))))))(((....(((((.((((....(((((...(((.(((((((((((((((((.........))).))))).......)))).))))).))).))))).)))).)))))......)))))))..)))...))))......)))))).)).......))))))))))))..............(((((((.((((((...(((.(.((........)).))))..))))))))))))).....(((((...)))))...................(((((..((((...))))..))))).))))))))....))))))..)))))))))).)))).))).)))))))).))))))))))).))))))))))))).............))))))(((((((.((((((((((((.......((((.((((...(((((...)))))...)))).))))........((((((.....((((((....(((((...((((..((.((((((.((((.(((............(((((.......)))))(((.........))).........((((((.(((..(........)..))).)))))).......((((((((((((((.(((..(.......)..))).))))....))))))))))....(((((((((..(((.((.............)).)))...)).)))))))))).)))).)))))).))..)))).))))).......)))))).......)))))).))))).....)))))))...)))))))..((((....))))...(((((.((((((((((.....)))))))))).)))))..))))))).)))))...)))))))....)))).)).)))((((((...((.(((.((((((((....((((.........))))......(((((((....))))))).))))).))).))).))......)))))).(((((....))))).(((((..((((.......))))..))))).....)))))))))))(((((......)))))....................(((((..((........))..))))).(((.(((((((((........(((((.((....))))))).(.((((.(((.....((((((......))))))......((((((...)))))).))).)))).)(((((((...(((((.((....(((((((..........)))))))......)).)))))..))))))).))))))....))).)))))))))))..)).))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((.............)))...(((((((((..((((((((((((.((((((((((((((((({...(((((((....(((((.(((((((.{(({(((((((..,((((,((((((({....{{.((((((((({{...(((......}}}..,|,||.((((((((.....)))))))).....(((......))).,.,..((((((................)))))).,.(((((((....)))))))..{{((((((((.....)))))).)))))))))))))..,...(({{.||||,..{|||||{|,|,....,..............}.)))})))).........{((((....))))}.....(((((...(((((...)))))...)))))..(((.....)))........((((((((..........))))))))((((((((((......))))).))))).....((((((((((((((((((({(((((,....|||||}..(((((((.{{(...,}}...))))))).....|||||...,,,,((((((((((((((((((.,{.,((((,,(((((....)))))..,,|...((((({....}))))).}}(((((((.((...{.((((,.(((((((....((((..(((((((.,............)))))))))))..)))))))..,.))))....)).))))))).......,.((((((((.{((({.,{(((({{.,,..,.....}},}))}}.)))),})})}))))))))})))}}.)))},)))))))))))))).......})})){{{.((((.((((((((((.....((((((..,,((((((((...((((.((((((((....,,((.((((((,((...((((.{.(((..{(((,((((((((........)))))))}(((....(((((.((((....(((((.,.(((.(((((((((((((((((.........))).))))).......)))).))))).))).))))).)))).)))))..}}}.}},))}}..))).}.))))......)))))).)).}}....))))))))))))..............{((((((.(((({{.,.{{{,{.{{........)}.}))).,))))))))))))}.....{({((...)))))................,,.(((((..((({...})))..))))).)))))))).,,.))))))..)))))))))).)))).}},.)))))))).))))))))))).))))))))}}}},.......,,,}}.)))))))..})}||((((((,.(((((({..,..,((,(,,,.,,||{{,...}}}}|,,.|}}|.||||,.......((((((.....((((((.,..(((((...((((..((.((((((.((((.((({...........,((((.......))))|(((.........)))}.,,.....((((((.(((..(........)..))).)))))).......(((((((((({({{.(({..(.......}..))).})))},..,}))))))))....{((((((((..(((.{{.............)}.)))...)).)))))))))).)))).)))))).))..)))).))))).......)))))).......)))))).,,,}}||,..,}|||},...},.}))}.})))))}}))))),..(((((.((((((((((.....)))))))))).)))))..))))))}.)))))...))))))}..{((||{.||.,,||||||{||,{{.({{.{(((((({....,{{{,,,,,,...})}),,,,..{(((((,....})))))}.})))),}}}.)))}}|,....,||},,,.||{|{....}}}}}.{{|,...,|,}.,,....,||{...}}.,},},)))))))))))){((((......})))}......,||...........{{{{{..((........)}..)))}}.({{.(((((((((,,......{((({.......,,}}},}.,.((((.(((.....,,,,,({,,...))))}}......((((({...}))))).))}.)))),.(((((((...(((((.((.,..(((((((.,,...,,..)))))))......)).)))))..)))))))}))))))....))).)))))))))))..)).))))))).
Forensic Context

No forensic context available.