Basic Information

Symbol
hsa_DENND4C_0016000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-DENND4C_0279
Host gene
DENND4C
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:19316415-19336412 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:19316417-19336414 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-313.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -337.89 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 289.56
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(.((((..(((((.((.(....(((.((((.(((.....(((..((((.............)))))))...))).)))).)))....))))))))..)))).)..............(((((.((........(((.((((.((.((((.....(((.((......)).))).......)))).)).))))...)))...((((((...(((((....)))))...........((((((.....)))))).....(((((.....((((...........))))....(((((((.(((.....)))((....))............((((((((((.((((........((((.....((((((((..(((((.(..(((((((.((..(((((((((((((((((((.(((..(.....)..))).))))).)))))))))))))).)).)))))))..))))))...)))))))).....))))........))))))))))))))))))))).........)))))(((((..((((((.(((((......)))))))).)))..)))))))))))))..))))).....((((((.(((...((((((((.(((...((((((((.......((((((((((((..(((((((((((((((......)).)))))))....((((((((((((((...(((....))).....((((.(((((((.....(((((((.(((((........(((((((.........(((.(((((((((((((.((......((((...(((((....)))))....))))........)).))))..))))))))))))(((((((.((((.((((..(((.((((((((.((......)).)))).)))).)))))))...(((((....)))))......)))).)))))))..((((((..(((((((((.(((.((((.....))))))))))))))...))..)))))).)))))))))))).))))))).))).)))).))))....))))))))))))))..(((((((((.....)))).)))))...))))))))))))))))))...(((.((.(((.(((((.(((.(.((((((((........)))))))).)..))))))))...))).)))))..(((((((....)))))))..))))))))...))).))))))))..))).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
....{.((((..(((({,((.{....(((.((((.(((.....(((..((((.,........}}.)))))))...))).)))).)))....})))))))..))))............,{..(((((.(({..,,...{{{.((((.{(.((((.,...(((.((......)).))).......)))).)).))))...))},|.((((,,..}||{||,,.,|||||{,,,.......((((((.....)))))}.....{((((...,.((((...........))))....(((((((.((,,,{{{,,,,{,,,,}}}|,........,((((((((({.((((,,......((((.....((((((((..(((((.,..(((((((.,(,.(((((((((((((((((((.(((..(.....)..))).))))).)))))))))))))).,),)))))))..})))))...)))))))).....)))).....,,.))))}))))))))))))))))..,......}}))){((((,,,(((((.(((((......)))))))).))),.))))),})}})))..)))))..,,.((((((.(((,..((((((((.(((...((((((((.......((((((((((((..(((((({((((((((......,}})))))))....((((((((((((((...(((....))).....((((.(((({((.....(((((((.(((({,......,(((((((.........{((,({(((((((((((,((,{,...,.{{,..{((((....))))}....,}}},||,...,}}.})}}..))))})})))),,||||||,|||{.|||..|{||.||||{{{{,(({,{{,,{{,||||,||||,|}}}}||.,.{{{{{,.|,|||}}..,}}|)}}}.}||}}}},,{{{{||,.|{{|||{{{,|({.{({{.....))))))}))))))).,,)),,)))))}.)))))))))))).})))))),}},.}))).))))....))))))))))))))..{{{{(((((.....))))},})))...))))))))))))))))))...{{{(((.(((.((({({(((.{.((((((((........)))))))).}..))))))))...))).))),)..(((((((....)))))))..))))))))...))).))))))))..))}.))))))
Forensic Context

No forensic context available.