Basic Information

Symbol
hsa_DENND4C_0017100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-DENND4C_0272
Host gene
DENND4C
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
9:19323853-19328160 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:19323855-19328162 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-195.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -213.07 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 242.26
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((.........((((((.....((((((.........................))))))....))))))..........))))))).((((((((((((.((.....(((((....)))))......(((((((..........(((.....))).(((((..((((((...((((((.(((.((......)).)))(((((((((.(((((((.(((((..((.....))..))))).((((((.......))))))))))))))))))))))))))))...)))))).))))).................((((((((..(((........)))..))))))))..(((...)))...(((((...(((((((((((.(((((.(((....))).))))).))))))))).))..))))).)))))))..)).)))))))...((((((...((((((.((((...)))).)))))).))))))(((((((....((.((((((((....(((((((((((.((((........((((.....((((((((..(((((.(..(((((((.((..(((((((((((((((((((.(((..(.....)..))).))))).)))))))))))))).)).)))))))..))))))...)))))))).....))))........))))))))))))))).....)))))).)).))..))))))).((((((.(((((......)))))))).)))..(((.((((((...(((((.((.((((((....((..((((.((.(((...((((((..........))))))....))).)).))))...........)).....)))))).))...)))))(((((((((.....)))))))))...)))))).))).)))))...((((........)))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
{((({(((..,,.....((((((.....((((((.........................))))))....)))))).,,,,,{...}}|||||,{((,.{{{{,,{.||,.,..(((((....)))))......(((((((........,,{((....,|||,(({{(..({{{{,{((((((((.(((.((......)).))){||||||||,|{(((((.{{|||..,,.....,,..})))},((((((.......))))))}}}}))})))))))))})))}},,,}}}}}}.}}}}}...........,,....((((((((..(((..,.....)))..))))))))..{{|,..}}}...(((((..,{{(((((((((.(((((.(((....))).))))).))))))))).})..))))).}})))))..||.|,|||||.,,|,{|||,,.((((((.((({...}}}),)))))}.}}}}}},{{{{{{.||,{|,|||{{{{{....(((((((((({.((((,,......((((.....((((((((..(((((.,..(((((((.,(,.(((((((((((((((((((.(((..(.....)..))).))))).)))))))))))))).,),)))))))..})))))...)))))))).....)))).....,,.))))})))))))))).....))))}}.,),}},},|{||||,,{{(((.(((((......)))))))).)))}.}))}},,|{{...{{{{{,{{.{((({{..,.{({{((({.,{{(({{,.,,,|||,,}|.......,))))|||.},}|)},,,|,.,|||||,|,.,},.,},)))))).}}...|||||({(((((((.....)))))))),...}}},.},}}}|,|},...}|||,.,}}},..}}},.,,...,})
Forensic Context

No forensic context available.