Basic Information

Symbol
hsa_DENND4C_0017700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-DENND4C_0211
Host gene
DENND4C
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
9:19324506-19325935 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:19324508-19325937 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-333.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -360.18 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 462.19
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.((((....)))).)))(((.(((((((((((((...(((((((......(((((.......)))))..(((((((((..((((((((((....((.((((((((((.(((...............)))))))))((((((((((((((((((((((.....((((((...........))))))......((((...((...............))...))))(((((((((((((....(((((((((((((((((((((((((((((.........)).))))))........(((((......)))))...(((((((............((.((((((((......(((....)))...)))))))).))...........)))))))...((((..(((((.....(((((((..(((.....))))))))))...))))).))))..)))))))))((((((....))))))((((.((.((.((......)).)).)).))))........................(((((((((((....))))))))))).((((((....(((((((((((((..(((((.(((.....))).)))))..))))).....)))))))).....)))))).(((((((.....)))))))...)))))))))))).....)))).....)))))))))((((....))))....................))))))))....(((((((((..........................)))))).)))..(((((((((.((((((........)))))).))))..))))).(((((((...(((..(.((((((((((..(((((((((((((((((.((((((((((...))))))......)))).))).((((((((((........(((...((((((((((........)))......)))))))((((((.....((((((((.....)))))))).......))))))..)))........))))))))))............((.((((((......)))))).))............((((((......)).))))....(((((((((((.........(((((......((((((....))))))....)))))..........)))))))).))).....)))))))))))))).....(((((.......)))))..((((....)))).....))))))))..)).)..)))...)))))))))))))))))))))......)))).))....)))))))))).)))).)))))...))))))))))))))))))))..........(((.(((((((((((((......))))))))))))).)))(((((......))))).....)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.((((....)))).)))(((.(((((((((((((...{{((((({{{{,{.....,,{(((({{{{{{,..{{{{{|{|||||||{{{{{,..|||,.||||||{((.(((((.(((.{,{,,,,.|,,|{{{{.((((((((((({{,((((((({{,{,.((((((...........))))))...}}..|}}}}...,}}}},,}}}}}}..|,||||,,|||||{|||{{|||,{{{(((((({{{{{((((((((((((((((((.........)).))))))........(((((......)))))..,(((((((.,,,,,......((.((((((((..,,,,{{{...,)}}...)))))))).))...........)))))))}..((((..(((((.....(((((((..({,.....,),)))))))...))))).))))..})))))))){(((((....)))))}.,||}||}||}||,}},}})).))})).,},....,..,,,,,}.,..}}}},,..(((((((((((....))))))))))),(((((,...,|||||{{((((({,,(((({.{{{.....}}}.}))}},,|||||,.,,,}}||||||.,,,,|}}|||,{{{{{{|,||,.||||||||,,|||||||}||||.....}}}}..,,,}}}||||||{{.,,,,,|||||{|.|||...,,,,.,.......,}}|,,...|||((((((,,,.,,||||,....,,,,}...,..)))))).}}}..{||{{{{{{,{{{{{{........)))))}.}}}},.,,))),|.|||},,..|||.||||||||.,{{|}}|||||,,,,(((((((..{{{.((((({...}))))}..,,,,|||,,{({.(({...}}}}}},{{{{(((((,.,........}))))}))}.}))))))....{(,.((((((.....((((((((.....)))))))).......))))))..}}......,,}))|||,,,.,,,,,,|}.,.,,|,.{{((((......))))}|{{((((({...,.,.((((((......)).))))...}||||||||,,{......,,||||||,,,||||||||{,,,,||||||{,..}}}}},{,..{{|,,}|||||}},,}},|,,,|}}}}}}}}}}}}},,,,.,||||......,}}))}.,|}|,.....,}},..,}}}}}}}}},}}|||{||{.,...,)))))))}}}}}}}}}}},...,}}}}}}|}}|}},}}})}}}||},}}))})),}}.,|}}}}}}}))))))))))))}||,.......{{{.(((((((((((((......))))))))))))).})),{{{{,,....)))),.....)))
Forensic Context

No forensic context available.