Basic Information

Symbol
hsa_DENND4C_0025100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-DENND4C_0208
Host gene
DENND4C
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
9:19353842-19354644 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:19353844-19354646 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-169.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -183.57 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 155.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.............)(..(((((((.(.(((((((.(((((((((((((((.........((((((..((.(((((.............(((((((((....)))))))))((((...................)))).(((..((.......))..)))..((((.......(((......................)))........)))).......))))).))...))))))...)))))))..........(((.(((((((...............((((.(((((((((.....))).))))))))))...............))))))).))).............((((((.(((....))).))))))...........)))))))).)))(((((((..........)))))))(((((....)))))...((((.((((......)))).)))).........(((((((............)))))))(((((((((........)))))))))...............(((..((.....))..))).....(((((((((.....((((.......)))).........(((((.....))))).........(((((((.........)))))))........((((((.(......).)))))).....))))))))).((((((((((....................((.((((((((...)))).)))).)).)))))))))).....(((.((....)))))..)))).).)))))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..,,....,}...)(..(((((((.(.(((((((.(((((((((((((((...,,,...((((((,,((.(((((..,{,.......,{((((((({....}))))))))|..,.,..,.,.........,{{(,.((((,,.{{{....))),.)))),.||||.......|||......................}}}...................))))).))...)))))),},))))))}..........{({.(((((((...............((((.(((((((((.....))).))))))))))...............))))))).}}}.,,.,....,{{,((((((.(({....))).)))))).....,.....)))))))).))){((((((..........))))))}{((((....))))}...,(((.((((......)))).)))|,,(((({..(((((((.,...,,.....}}}}}}}(((((((((........))))))))).,..........,})))|})}.,,},.)),}))},,...(((((((((.....((((.......}}}}.....{,,.(((((,...,)))))..,........,||,,...|||..,}}|,|||,,,.,,..{{{{{{,|.,....),)))))).....))))))))).((((((((((....................((.((((((((...))))}}))).}),)))))))))).....(((.((....)))))..)))).).)))))))..)
Forensic Context

No forensic context available.