Basic Information
Symbol
hsa_DENND4C_0026200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-DENND4C_0187
Host gene
DENND4C
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
9:19360242-19361795
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:19360244-19361797
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-398.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-428.88 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
384.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.(((((((((((............(((((.((((....(((((((((........)))).(((((((.......)))))))((((((((((.((((((..(((((...............))))).))))....))..))))))))))......(((((((....)))))))...((((((((((.(((...))).))))((((((((.....(((((.....(((((.(((((((.((((.((...)).)))).))))))).)))))...))))).))))))))...........))))))...)))))....)))).))))).......(((.(((......))).)))...........((((((((((((..(((((((((....(((((((((((..(((((........))))).))))..))).)))).....))).)))).))..))))))...))))))(((((((...........)))))))((.(((.(((((((((((....((....))....))))))))))).)))))..))))))))))).)))).(((((((...)))))))(((.(((((........))))).)))((((((((.........)))))))).........((..(((((((........)))))))..)).(((((((((((((.........)).)))))))..))))......(((((.(..((((((((.((((.((........))))))..))))))))..).))))).......)))((((..((((..((((....(((((((.((((.(((((.(((((.((((.((((...((((((..((...(((((((((((.(...(((((.....)))))...)))))(((((......(((..((((((.(((...................))).)))))))))...)))))........((((((((((((.........))).....)))))))))..............((.(((((((....))))))).))(((((...)))))....)).).))))..))..)))))).)))).)))))))))...)))))..)))).))))))).))))((((((....))))))...(((((((((((.((((.(((((.((((((..(((.......))).)))))))))))..((((((..........))))))..............(((......((((.......))))......)))..(((((.......(((.((((((.(((.((((((((....(((..((........))..)))......)))..........))))).)))....)))))).))).......)))))...................(((((..........))))).................((((....))))..........(((((((((((..(((((...)))))..))))))))))).)))))))).)))))))..................))))..))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((((((((((.,..{{(((...(((((.((((....(((((((((.,....,.)))).(((((((.......)))))))((((((((((.((((({..(((((...............))))).}}}}....)}..))))))))))......(((((((....))))))),..((((((((((.(({...})).)))}((((((((.....(((((.,,..(((((.(((((((.((((.((...)).)))).))))))).))))),}.))))),))))))))..........,)))))).,.)))))....)))).})))).......(((.(((......))).)))..,,....,,,{(((((((((((..(((((((((....(((({(((({{..(((({........))))).)}}}..))}.)))).....)))}))))},)..))))))...)))))}((((((({........,.))))))).{,{{{,,(((({{((({....,,.,,,,},,..)))))))})))))},}...))))))))))))))))))}{({((.,,|}}||(((((.......))))),..........((((((((.........)))))))).....,...((..(((((((........)))))))..)).(((((((((((((..,....,,)).)))))))..)))).,{{{{((((,{({{(,(,(((({{((((({....,,,,|}}}}}.|)))),,,,,|),},,},........}}{{{{........{,,,....(((((((.((((.(((((.(((((.((({.((((...((((((..((...((((,{{((((.{...(((((.....)))))...}))))(((((.,,...(((..((((((.(((....,,........},...))).))))))))).,,)))))...{{{{{(((((((((({{.........}}}...,,))))))))}.............,{(.(((((((....))))))).))|||||...,}}},....,}.}.))))..})..)))))).)))).}))))))))...)))))..)))).)))))))..,,|{((((,.{{{|{|,.|,,,|{({{{{{{{{.{{((,(((((.((((({..{,(,,,....,}|,||}}}}}}})),.((((((..........))))))........,|||,.|||}}}}}}|||,...,|,,}})}.,,,,,})),}||||,..,.,,.{{,.,{(((({(((.(((({{{{..|||||}}||..,,....}},,}||||,,,,|||..........}}}}}.))).,..)))))}.}))}..,}}}}}}}},,,,,|||,,..,,,....|}))))).,}}))).)))))}}},.............((((....))))..........(((((((((((..(((({...)))))..))))))))))).|||||,,,.,,))))).........,},,}},}|||,,..,)))
Forensic Context
No forensic context available.