Basic Information

Symbol
hsa_DHX34_0000400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0051674 hsa_circDHX34_004 hsa-DHX34_0013
Host gene
DHX34
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
19:47856011-47863327 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
19:47352754-47360070 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-660.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -691.14 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 495.28
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((.((((..((((((((((((.((..(((((((((((.((((((((((((((..(((((((....((((.((.....)).))))..((((...)))))))))))))))))))))))))))(((((((((...((((((........((((....)))).......)))))).)))).)))))..(((((..........).)))).))).))))))..))...))))))))))))..)))).(((((...(((......)))))))).........((((((.......))))))(((((((((((((..((((((((((((((((..((((((.((.((((((((.((..((.(..(((..((((((((.(....(((.((((((((((((.....))))))...))))))...((((((.((((....)))))).))))..((.((((((((...((((((........)))))).)))))))).))....(((((.....))))).....)))))))))))).)))..).))...))))))....))))...)).)))))).........((((.((.((((.......((((((.....((((((((...))))))))..))))))..((((((....))))))))))..)).))))...((((..(((((((((...(((.((..((((.(....)))))....)))))...)))).)).)))..)))).((((((..(((((..((....((((((.....).)))))....))..)))))..))))))..))))).)).)))))))))...(((((((...)))))))((((.....))))..((((((....))))))(((((.(((..(((.((....)).)))..))).)))))..)))).)))).)))))((((...(((((..((.(((((((((((((...))))).......)))))))).)).)))))..)))).((((....((((....))))))))((((((((((((....(((((..(.((((((.((((((((..........)))))).....))..)))))).)..((((......(((((((.((.((((....).))).)))))))))......))))(((((((.((((((((((.(((((.....(.((((.(((....(((....)))...))))))).)...)))))...((((..(((((.(((((.........(((((((((((...(((((..(((((....)))))............))))).)))))))).)))(((((((.....(((((.((.......)))))))...))))...)))...((((((((..(((....)))..).)))))))(((((((((((((((......))))))..))))))..)))))))))))))..))))..)))))))))).)))))))..........((((((..((((((((((((((...))))))...))))))..))..))))))....)))))...))).))))..)))))...)))))))((((((.((((...............)))).))).))).(((((....)))))(((((((.(((....))).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((.((((..((((((((((((.((.,((((((((({(.((((((((((((((..(((((((....,{{(.({.....}}.}}})..((((...))))))))))}))))))))))))))))((((({((,...((((((...,{{..((((....))))..}},..)))))).,}}),)))))..(((({..........).)))).))),,))))),.}}...))))))))))))..)))).(((((...(((......))))))))....,{{{.((((((.......))))))|||(((({{((((.{,{{,,,,{||||||||,.((((((.((.((((..,,,(...((((({(((..{(((((((.(,,{.((,.((((((((((((.....)))))),..})))))...,|,,,||||(({{{((,{({|{{.||{,{{.,,{||{||,.,||||||}}}.}}}.},||||,|,,,,)))}))....(((((.....))))).......,,)))))))}.}},.|}.}}}..)))))...)}))))...)).))))))....,,{..,,,|}|..((((({({{,,{{{,(({{({{(({{{{((,,,|||||||...|||||,{(,(((,({.{{{||}|||{,,..,,.)))),|}}||.}}}}|.}))}}}}.{{({(({{((((..,{((((((((.((........,.)).)))))))))}{{.((((((..(((((..((....((((({.....).)))))....))..)))))..))))))..)}))}.))})))))))}}...(((((((...)))))))((((,..,,||||,{((((((....)))))}(((((.(((,,(({.{{,,,.||.|||,.||}.|||||..|||||||||,||}||.,,,,,.,{(({.,({{{{({{(({{{,,{{((|,|,,,,,,..,)))),.,,{{{{{{||....,,|{{||||,..{{||....))))|||((((.(({..{(({{.....,,}}}}||||||}|||(((((,.........}}||||,...{||{{||||||{...((((...,,.(((((((.((.((((....,.))).))))))))),,,...))))|||||||.,{(((((((({((({(,{,{,(.((((.(((....(((....)))...))))))).,...,,,,,...,(({..,,,,,.(((,,...,||...||{{{||||||}}}|||||,}|||||}}}}))))),.....{{{{|.,,}}),)))))))),))))}}))||}}}..{{{,..{({{{.{{.||||}}}...)))),}}),)})}((((((((..(((....)))..),,))))))({(((((((((((((......)))))}..)))))))}})|||})))},))..,,))}})))))))}})})))))))}}....))}}||{{{{.}||||{{|||||||,,,}))))),...,))}))}}))|.}))))).}.)))))))},)),..}))}})))),...))))))),|{,(({......}}},,{,...,,....}|||||}}..||||{{,...,))}|((((((.(((....))).)))))))
Forensic Context

No forensic context available.