Basic Information

Symbol
hsa_DLGAP4_0001700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-DLGAP4_0011
Host gene
DLGAP4
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
20:35060049-35064753 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:36431646-36436350 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-538.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -555.67 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 332.73
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((((...(((((((((((((((((.....((..((((....))))..)).....))))))).))......(((...((((.....))))...)))))))))))((((((.(((..........((.(.(((((....))))).)))..........)))...))))))((((((((.((((((((.((((((((((..((.((...(((((......))))).))))..)))))).................((((((.(((((.....((((((...(((((.(((.......((((((((....)))).....)))).((((((.(((..(((.(.((((.((((((....((.....((((((.((((.((.((((((((((.(((.((.(..((((.(((((......)))))...))))..).))))).......((((((.(((((.(((.(.......).))).))))).....))))))))))))).....((((.((.(((((........))))).(((((....)))))....)))))).)))..))))))...))))))..))..)))))).))).).).)))..)))..)).)))).........))))))))((((((((((((.(((.....)))((....))............((((((.((.(((((((.......))))).((((.(((.(((((.(((.((....(((((((((((....))))).........))))))...)).))).)).))).)))..((........))..((((((..........)))))).((.(((((......................)))))))................)))).)).)).)))))).....))))))))))))(((((((..((((.........))))..((.((((...((((......))))...)))).)).....(((((((......))))))).......((((((..(((....)))..))))))((((((....))))))...))))))).........))))))..))))).))))))..((((....))))((..((((((......).)))))..)).)))).)))))))).....)))))..)))((....)).))))))))))......(((...((((..((.((((........))))..))...))))...)))(((.((((.(((.((.(((.(((.(((((....)))).).))).))).)).)))..)))).)))....((.......))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.((((((((((...((((((((({(((((((,,,..((..((({...,|}}}..)),.,,.))))))).}}......(((...((((...,,))}}...}})})))))))((((((.(((..........((.(.(((((....))))).}))...,......))}...))))))((((((((,((((((((.((((((((((..({{((,..(((((......))))).))))..)))))).................(((((.........)))))..,,......((((((.......{{{,{{{,..,.)))),..},)}})}|,((((((....(({,((((...{{{,,,.......,{{{{{(((((((...(({{,((((((((.{((.((.{..((((.(((((......)))))...))))..}.))))}.......((((((.((({{.(((|,,.,,,..}.))),)))))...,.))))))))))))))...{{{...|.|(((({........))))).,},|,,}}))))),....))))))}.})))))))))..}))),}}..)))))){|((.(((.(({{(((..,((((,,.,))))...,{(..(((((((((((..((((,((((,.....((((...((((.((((((({(...((((.....)))},.}})).....)))))))))...)))),.},,}))).))))..)))))).}}})))..))|((((....(((((.|,..{((,{,,.{.,||}.}}...||}.,,,,.,))..))))}......)))).||(((((,,.(((((......................)))))}}..)))))},|{{{,,{{|||||{.,|{||,|}|{(((((((((....))))((((((..((((.........))))...|,((((...((((......))))...)))).,))))}}(((((((......))))))).......((((((..(((....)))..)))))){{((((....))))))...}.............))))))),..)).}))))}))}).||||,{{.,,,,}}))))))))))).)).,...))))}),)))).)))))))),,..,)))))..))){{....)).))))))))))......(((...((((..((.((((........))))..))...))))...)))(((.((((.(((.((.(((.(((.(((((....)))).).))).))).)).)))..)))).)))....{{.......}}.,
Forensic Context

No forensic context available.