Basic Information

Symbol
hsa_DNAJC6_0008500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-DNAJC6_0019
Host gene
DNAJC6
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:65830318-65854098 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:65364635-65388415 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-275.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -293.25 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 277.66
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((..(((((....)))))((((....)))).))))).......)).((((....(((((((((((..(..(((((((....))))))).)..)))).....(((.((..((((....))))..)).)))........((((........))))(((((((.......)))).)))....)))))))((((((.(((((.(((((........))))).(((((...((((((((.(((((((((((..(((...))).)))))....)))))).)).))))))...(((....))).........(((((((.(((((....(((((....)))))...((((((.(((((..(((..(((((((((....(((((((...))))))).......((((((.(((.(((((...........)))))))).))))))...((((...((((((((.(((....(((((((..((.((((((............(((.(((((....(((((.((((((..................((((...)))).(((.((((.....))))..))).)))))).)))))...)))))..))).(((.....)))(((((...(((.((.((....)))).))))))))..))))))))..))))))).((((.((((..(((..(((((.((.((..(.(((((.((((((........)))))).)).))).)..)).)).)))))..))).))))))))...............)))..))))))))))))...(((((((.((........((((...))))....)))))))))(((((.(((....))).)))))..((((((......))))))......)).))))))))))))))).))))))..))))).)))))))))))).........(((((.((((((.....)))))).........)))))))))).)))))).......)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.(((((..(((((....)))))((((....)))).))))},.}{{{({{{(((({{{{((..(((((((({(.{(((((((....))))))}.{{{|{,{.....(((.((..((((....))))..)).)))...{,.((((,({{{.{{{.,,,..,{{((({{,,{{.,,||.|||,|||{|,||||,{{,,,.,||||,{((((........))))}..|,||,}}||||{{{{.(((((((((((({,,....}}},|}}},..,,)))))).||,|,}|||...,,,..,,|}}...,,,.,}|||,{||,|||||,...(((((....)))))...|||,,|}||,||}}.||.,||||(((,....}||||,||}},,,,})))}}..}},||||||}|||}{{{((,...,,,....|||||,},.))}}},...,...,{{((((((((.(({....(((((((.,((.((((((.....,,.....{((.(((((..,.(((((.((((((..................((((...)))).,{{.((((.....)))),,})).)))))).)))))...))))).,)},.{||.,...}},(((((...(((.((.((....)))).))))))))..)))))))).,))))))).((((.((((..(((..(((((.((.((..(.(((,({((((((........)))))).)).))).)..)).)).)))))..))).)))))))).............,{,,|{{||||||||||||{..((((({{{((...,....(((,...))))....))))))))),,|||}|,|...,)))}))))}.}{(((((......)))))}....,,}),))}}}}}}}}|||,}{||||||..,)))).,)))}}))}},})))))))}}|{{{{.{{{{{{.....})))))........{|||,,.....))))......,,,,,.}))
Forensic Context

No forensic context available.