Basic Information

Symbol
hsa_DNAJC6_0011700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-DNAJC6_0046
Host gene
DNAJC6
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:65855007-65879999 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:65389324-65414316 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-872.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -930.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 942.37
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((...(((((..............(((((..((((.((.((((.......(((.......((((((....(((((....((((...((((.....))))....))))...))))).....((((......))))....))))))....))).....))))))...............((((((((((((..........)))))....))))))))))))))))(((((((((((...((((.((((((...(((.((..((((((((.....(((((.........))))))))))))).)).)))..))))..))...))))......)))))))))))......((...((.....)).)).(((((((((............(((((.((((((.(.(((..(((((((((..(((((((((.(((((..(((((.(((((((((...)))..(((((((....(((.......((.(.(((..((..((((((((((((((((.((((........((((((......((((.(((((......))))))))).((((((....))))))))))))........))))..))).)))))))))))))))))).)))......))))))))))...((((((((((((((((((((((.(((((((((..(((....((((((((..((((((((((......))))....))))))..)))..)))))....((((((((((((..(((....)))...(((((((...((.........)).))))))).........(((((....))))).(((((((.(((((((.(((((((....)).))))).)))((.(((......))).)).)))))))))))((....((((.((((.(((((.(((((...........((((((((.(((((((((((((.((((.((....))))))..((((((((((..((....((((((((.......)))..)))))((.((....)).))((((((((((((((...((((.........))))....))))))((.((((((.(((((((.........((((....))))........))))...))).)).)))))).....(((....))).(((((((.........((((((..(((((......)))))(((((((..((..(((((..(((((((.((..((((.........))))..))...))))))).....))))))))))))))...........))))))............)))..)))).....))))))))))..))))))))))..)))....)))).)))))).)))...........)))))...(((..((((((...((........))...).)))))..)))(((........)))...)))))...))))))))).))))...)).)))))).))).))).(((((...)))))....)))..))))))))).(((((......)))))..(((...(((((.........)))))..)))(((((((.(((.((......)))))))))))).......((.((((((((((..............))))).......((((((......))))))(((((((((..((((((((((((((.((....))...(((.....)))(((.(((((.(((.((((((((.((..(((((...........)))))..))..((((((((((.((.((((((....(((((((((((((((..(((((((((.....(((((.((.(((((((((...(((..............)))...))))))....(((....))).))).))))))))))))))))...((.(((...))).))(((((((((((.......((((...(((.....((..((......))..))....)))....))))......)).)))))..)))))))))))))...)))))).....)).)))).)).)))))))))).(((((.((.((((((((((((..(((((......(((((..(((((((((((((.........((.....(((((((...........(((((....)))))(((((.((((.((......)))))).)))))....(((((....((...........))...))))).......(((((....(((((..(((((.........((((((((.....((((((..((((....................)))).))))))((((((.....(((((...(((((((......))))))))))))((..((((.(((((....))))).))))..))))))))...)))).))))................))))))))))....)))))..))))))).....))...........))))).))))))))...)))))......)))))..))))))))).......(((((..(((((((.(..........).)))))))..))))).)))))))))).))))).))).)))))))).)))...))))))))).)))))..)))).)))))......))))).)))))))).)).))))))))..)))))).......).)))))))))).)))))..))))))))).(((....)))((.((((........)))).)).))))).))))((((.((((((((((((...((.((((((..........))))))))..))))))))....))))..))))......)))..).))))))...)))))....(((.(((((((.............))))))).)))...((.((((((((....))).))))).))...)))))))))........))))).))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,,...(((((.{{...,(((.....}}}}.,,,....,|{((({((....{.(((({...(((,(.{{{{(((((.((((((((((.(((({,{{{|....,,{{{{,..{||||,,,..((((,...,,||||........{(((((((({...((((((((({...((.({,((.,{{..||||)})..,.,.{((((((..{{{.....}}}((((((({{({{||(((,(({(((.{.(((((,,...|||.....((((((((.....(((((.,.....,.))))))))))))).{{{,,{{((((...))),.))},}}}...},,,.|{{((...((((((((.((........)).}}.{{{,(((({((,((((..(((.((((.......))))..)))..)))).))).))))..,|.|,....))))))))))},}))))).))))))}}}...,{{,,.......}})}{{{{{{..{((((((((((((((((,((((.....,,.(((({{...,,.,(({|(((,,...{..||,)})}}}.((((((....)))))),,}}},....,...})))..))),}))))))))))}},.{,{{{{,.,,,....,{{|||,((((((,,.,||}}}..}}}},}}))})}))}}}}}...||,.}})))}}|||..||||||((((......)))},,..)}})))..))}}))))),...}}}}||.|}}}}}}|||{{{,..{,{{.(((((((,.{(({...,},}.}..|}}}}}},{{{{{,,,,,,)}}}}|(((((.((..((((.,((((((((....,..(((((({.((..{(({.,{{...,,.|||{{{{|||||{{|..,||..,,,,}|.})||..|||||,{{,{,...({{{{..((((...}})),,,,.}}}}}.,}...}})}....{{((({..{((((((((((({....,(((.((((.(({...{{.{||||}||{{{....,{{||||{,,{,,((((......)))).,,.}}}})))..))))))),))))))))).})))))}}}}}}}....||||,,}.})),,..}}.,}))))).,...}))})))),,..}}}}..}}}}}}}.....,,,.........|||,({|,||,||,.}})})))))),|{{.........)))|...,,.}}......}})))},)))).......,|||,,.{|||||}}.((((........)))).|||||||..||}|,.....,.......))))))).||.,....},))))}.)))),.))))))...|||{,,{||.,.}},}}},,||{,........})))}}..((((..((((((...((........))...)})))))..)))).,..,|,,.,|}}.,,,))))}|((((((.((((.(((...))).))))..{((..((((((((..(..(((((((((((.....(((((((,,{,,{{...}))),...})))))),.((({,,(((((((((.....(((((((.{((.{.......}}}}}))))))).|((({.({{((((((((((............},))))||....((((((..((.(((((((.(((((((((((((((((((({..(((((,.{{,|(((((,{{{...|}}}...|||}||||,.|||}|,.,.,{{,,,.(({,{....,{,{|||{{{{|,..((((((((((.((.((((((....(((((((((((((((..(((((((((.....(((({{((.({(((((((...{{(..............})).,.))))))}...{{{....))).,}).))))))))))))))))...((.(((...))).}}(((((((((((.......((((,..{((.....{{..((......))..))....)}}....))))......)).)))))..)))))))))))))...)))))).....}}.)))).)).)))))))))).,{{{{{{{,{{.(((((((((,,(((((......{{(((.,({{{(((((((((..,,.{{{,.,..,{{{{{{|||.,,,,|||,..(((({....})))),{||(,{{{,|||,.....})),}},)})}||{,,||}}}})},},........,,,})},,))}},,,,}},.|||||....,{{{|,.,{{{|{{{{,||{{{{{,,.,,..,{{(((((,..(((({,,{,,,.........,,,,|,,,.}}}|||(((((,,,{,.{((((...(((((((......))))))),))))((..((((((((((....)))))}))))}.}))}}}}}...,}}},},}}...........,{{{{||||,,}}},....}}}}}..}}}}})),,...,|.....,.....}}})}.)))))))),..}})))...}},)}))),,)))}}}}},,}}))}}}}})))))}||}})}}}}..,,..}})}),{(({{{{{{{{{{{..{{{{||,..,{{{{,,.,}})},..}.))))}.)))))})))))))))})))))),})))},))))))))..)).)))))..))..))))))..,)))}..,}}}..,)))}.,,,||{{{,.,,..})))).)))})}....,))))))))..))))))))))).,}.))))))))))}.))))))}.((((((((...((.((((((..........))))))))..))))))))....,|(({{.{(((((....((((.(.(((((((.,..,,.,.(((((....))))),}..,.)))))))).)))).)))))).})))|)))))))},).))),,))))),),,,,))))))}}...}.))))).,)..
Forensic Context

No forensic context available.