Basic Information

Symbol
hsa_DNAJC6_0012700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-DNAJC6_0034
Host gene
DNAJC6
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
1:65874467-65876564 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:65408784-65410881 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-573.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -612.38 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 398.14
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((.((..(((((...(((((....((((((((...))))))))....))))))))))..)).))).))))(((((((...((((.((((..((((((.....))..))))..))))..((((........)))).((((((((.....((((..........((((.....)))).((((((.(...((........))).))))))....((((((((((.((((((((((.(((........))).)))))))))).))(((((....)))))......(((((((((((.....)))))))))))....))))))))))))..))))))))))))...)))))))......))))((.....(((((.(......).))))).((((...(((((((((((((((((((((((((((..((((((((((..........(((..((((((((((((.....)))..)))))(((((((.((((((((((.(((................(((((((((.......)))))))))(((.(((((((((((((((.((((.(((((((.((...(((((((((..................(((((((...)))))))(((((.(((((.....))))))))))........)))))))))))))))))).)))).).))))))))))).))).))).............))))).)))))))))))))))))))..)))(((.((((.....)))).)))((..((((.(((((...........))))).))))..))......))))))))))..((((((((....))))))))...))))))...)))))...........(((......)))...(((((((((((((((((((((.((((.....((.((((((...(....)...))))))))...))))))))))))))...)))))))...))))...........))))))))))))))))...))))......(((((((((.....)))))))))........................((((....(((((.(((((((.....((((...))))...(((.((((((......)))))).))).(((((((((((.(((((((.......(((.(((((.((.........)).))))).)))....((....))...))))))).))))))))))).((((.....(((((..((((((((((.(((((((((((....))))(((.....))).....(((((((....)))))))((((((((....(((((((.......((((((((.(((.(((((....(((((((((((.((((...)))).))))((((((((((.(((((.................(((((((((..((............((((...(((((.........))))).))))..))..))))))))).(((((((((...))))))))).........))))).))))))))))..)))))))....))))).)))........))))))))..............)))))))..))))))))...)))))))...))))))))))))))).....)))).(((((.....)))))....(((((((((.((.....)).)))))))))...........((((...((((....)))).))))...((((((.((((.....((((((((....(((((....)))))...))).......((((............))))..))))))))).)))))).))))))).)))))....)))).....(((((((......(((((((((..((((((((....))))))))..))))))))).....)))))))............((((.....).)))(((((((..(((((((.....)))))))....))).))))..........((((.......))))(((.....((.(((((....)))))))...)))...(((((............)))))..(((((((........)))))))...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((.((..(((((.,,({{(((({..(((((((...))))))))))},}))}})))))..)).))}.))))(((((((...((((.((((..((((((.....))..))))..)))}..,{((,,......}))),((((((((.....((({..........((((.....)))).((((((.{...((........))}.))))))...,(((((((({(.((((((((((.(((........))).)))))))))).)|(((((....)))))).,,..(((((((((((.....)))))))))))....)))))))))}))..))))))))))))...)))))))......})))((.....(((((.{......}.))))).((((...((((((((((((((((.,,,,,{{{{,..(({(((((((,.........{(({{,{{.((((((((.....)))..))))}{{((({{{(((({(((,,.{{......,,,{{{{....(((((((((.......)))))))))(((.(((((((((((((((.((((.(((((({,((...(((((((((........,,.,......{{{||||...,|||}},(((((.(((((.....))))))))))...}},..)))))))))))))))))).)))).).))))))))))).))).)))...,,.{{{{{{{,||,,.,)),))))))),))}}||,{(({{(((.((((.....)))).))))}}}{||(,({,{|}}},.......,,,,)}))))..},,})}.}))}))))))),,((((((((....))))))))....}}})}...))}},.........,,||,,.....,||,..(((((((((((((((((((((.((((..,..((.((((((...{,...,.,.)))))))),,.))))))))))))))...)))))))...))))...........))))))))))))))))...))))...,,.(((((((((.....))))))))).,,...{{{{{,{{{,,.{{....{(((..,.{((((.{{(((((,,...,{{{...,}},...,{{.((((((......)))))).}},.(((((((((((.(((((((.......(((,(({{(((({....,)))),,))))).}))....{(....})...))))))).))))))))))),((({.{{{{(({((,.(((((((((({(((((((({,{.,.,...{(,,..,,.))}....}||||||.}}}.|||||||((((((((....(((((((.......((((((((.((,.(((((....(((((((((({.((((...}))).})))|(((((((((.(((((.................(((((((((..((............((((...(((({.........))))}.))))..))..))))))))).(((((((((...))))))))).........))))).))))))))),..}))))))....))))).,}}....,...))))))))..............))))))),.))))))))..})))))))...)))))))))),),))}}}}}))))}{((({.....))))}....{((((((((.((.....)).))))))))}...........(({{.,,{{{{....}}}}.)))}..,{|||{|,{{{{....,||||{|{{,,,,(((((....)))))...}}}.......{{{{,......,,,,,||}}..}}})})))),))}}}}.})))))).}))))....))}}.....(((((((......{((((((((..((((((((....))))))))..))))))))).....))))))).....,{,{{{{((({.....}.))),||||{||.(((((((.....)))))))...{||,.},||{|.,,,....{,,|,,.,,,,}}},|||.....((.(((((....)))))))...)))...(((((............)))))..{{{{{{{......,,))))))),..))
Forensic Context

No forensic context available.