Basic Information

Symbol
hsa_chr1_1014400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-DNAJC6_0073
Host gene
DNAJC6
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
1:65879040-65879748 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:65413357-65414065 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-131.17 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -145.90 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 209.80
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.........)))))....((((.((((....((........(((((((((..........(((((......................)))))))))))))).......))....))))..)))).(((((.(((((((................))))))).))))).(((...(((((((((.............((((((((((((((..((((.((((((((((((...........((((.((((.........(((.((((((..(((......)))....)))))))))..((((.....((((....))))...(((((....)))))((((((....(((.((....))))).......))))))((((((((((((....................))))).)))))))........((..((((((((.....))))))))..))..)))).......(((((........)))))......)))).))))...)))))))))....))).)))).)))).))))))..((((((........))))))....(((((((((((.(.........).))))))))))))))).............))))))))).))).............(((((((((...(((..................................)))..)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({((({{,,{,.,.}},,}|||,{{{{.((((.,..{{........(((((((((..........(((((......................))))))))))))))......,}}....)))}..}}}}.(((((.(((((((................))))))).)))))..,((((((((((({......,,.,))}}})})}}},,(({{{..{{{{.,,((((((({,,,,|||},...,||||,|((({,{{.,,,,(((,((({{{..{{{,.....})}....))}})}}}}.,((({,,{..((((....))))..,|||||....}))}},,(((({...{{,,||,,..}||}}......,}}}}},((((((((((((................,...))))),})))))).......|||,,((((((((.....))))))))..,}..,,,........{{{{|.,,,,,,.|||||,.||,.,|||{,},,..})))})))}),,,.}}}.))}),)))),.}}|||{,.,,,||}},.....,,,..,...{(((((((({,(((((((((.....{{{{(((....)))....}}}}....))))))))).......,}}}}}},,),,||||||{{{...||{.,,,,,,,,....,,|.,.,........,....,}}}..}))))))))
Forensic Context

No forensic context available.