Basic Information

Symbol
hsa_DSCAM_0000100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0116069 hsa_circDSCAM_030 hsa-DSCAM_0006
Host gene
DSCAM
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
21:41414298-41434826 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
21:40042371-40062899 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-228.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -241.19 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 196.74
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.........(((((((((.....(((..((((.((.....(((..(..((((..(((....(((.(((.(((.(((((((.(.(((........))).).))))).)).))).))).)))....(((.((((((((((...)))))).)).)).))).)))..))))..).)))...)).))))..)))...)))))))))....(((((((..((((........(((((((((((....))))...(((....)))((((...((((..((...))..)))).))))((((.....)))).((....)).((....))..((((((...((.((((......)))).)))))))).))))))).......))))........((((((..((.....((((..(((.....((((((..(((.........)))(((..((((.((.......(((.(((((.((....))))).))..))).......)).))))..))).......((((..(((....)))..))))..))))))............)))..))))...........))..)))))).........((((((((.((..............)).)))))))).........(((((.(......).))))).)))))))...........((((..(((((.....))).))....)))).....((((.((((..(((((.(((.(((.((.(((..(....)..))).)).)))))).)))))...))))))))...(((......)))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.........(((((((((.....(((..((((.((..,..(((..(..((((..(((....(({.(((.(((.(((((((.(.(((,.....,.))).).))))).)).))).))).}))..{,({(,({((((((((...)))))).)).)).))),)))..))))..).))).,.)).))))..)))...)))))))))....(((((((.(.((({{{,...,(((({,,,.{{...,{((((,,{(({((.{{|((((.,,((((,,((,,,|}..}|||,||}}((((.....)))).||....|{{((....||..((((((...{{.((((......)))).}))))))).||||,,},,,....},,,.,,,.,..,...,,,,{{......{{{{......,..|}}|}||||{,........}))}||{..((((.{{.......(((.(((((.{{....}}))).))..))).......}}.)))),.)),.,,,}},{{{{.,{{|....})}..)))).,,,)))}}}....,,,...,)}}}))))))}..}}..}})}}..||||}..,......((((((((.((..{........,..)).)))))))).....,,,.||||,.|,}},..}.)))),))))))))....,......((((..(((((.....))).))....))))...,.((((.((((..(((((.(((.(((.((.(((..(....),.))).)).)))))).)))))...))))))))...(((......))).,
Forensic Context

No forensic context available.