Basic Information

Symbol
hsa_DSCAM_0002500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0116073 hsa_circDSCAM_022 hsa-DSCAM_0013
Host gene
DSCAM
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
21:41496122-41539215 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
21:40124195-40167288 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-236.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -251.39 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 199.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((.((....)))))))).(((.....(((((((...((((....((.(.....).))..)))).))))))).....)))..........((((((.....((((..(((.....))).....(((((((((...((((((...))))))..((.(((((...))))).))...(((((((((.(((.(((...((((...((((....((((....))))..(((((((((.((((((((..((((((....))))))(((.....)))((((....))))((((.(((((.(..(((((((((.((.(((((((.(((((...((((.(((....((....))......(((((................)))))..))).))))(((((...)))))..((((....)))))))))............))))))))).)))).......)))))..))))))))))........))))))))....)))....(((((((((....((.((........)))).....)))).)))))))))))((((((((((.(((.((......((((.((.(((((......))))))).))))...((((((.......))))))))))))).))))))))...((.(((....))).))...))))..))))))).)))))))).......))))..(((......)))........)))))))))....))))....))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
,((((((.((....)))))))).|(,....,(((((((...({{{,,,.{{.|.,,.})},,..}))}.))))))),..,...,..........{(((({.....{(((..(((.....))).....(((((((((.,,{((((((((({......{(.((((,...})))).}}({{((((,(,,{,((({((,{{.,,,,,..((....}|{|,..,,.}}}}}),,},.}.}|})))))((((.((((((....)))))).)))).(((({.{{(((,,.({{...............}}}.))))).}.))))})))))))))..,,...,,,..,,(({,..||......(((((...............,||||}......,{{,(((((...)))))..||||....}))}||(({,,,({{.......)))))))|.||,|.,||,.((((.(((((((({,.,........))))),,,...)))))))).(((((((((....((.((........)))).....)))).)))))..((({{(((((((((,(((.(({{{{..((((.((.(((({......})))))).))))...,,(((,..,}}..)))))))}))))).)))))))))))((,(((....))),)),}))}...}))))}})))))),}}}.......|||}..{||,.....}})..)))...)))))))))....}}}}....)))))}.,
Forensic Context

No forensic context available.