Basic Information

Symbol
hsa_DSCAM_0004700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0116079 hsa_circDSCAM_018 hsa-DSCAM_0008
Host gene
DSCAM
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
21:41550854-41561165 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
21:40178927-40189238 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-165.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -173.74 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 171.25
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((....))))..............(((((......)))))))))...........)))((((.((.(((((((((((............((..((((((....(((((.................(((((.(((.....((((.(.((((((.....))))))).))))))).)))))...((((....((((((..((((((((.(((.((((((...((((((((.....................))))))))...))))))..)))..)))))))))))))).....)))).))))).....((((.(((...))).))))..............((((((((((((....(((((.((((((........))))))((((....((((((.........))))..)).....))))((.((((......))))))...((((((........((((....))))..........)))))).)))))...)))))))(((((....)).)))..(((((........)))))..)))))..)))))).))...))))))))....)))..))..))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((....))))...,{,.....,..(((((......)))))},)).....,,,...)))((((.((.(((((((((((..,,........{(,,((((((,,,,(({((,{{{,,{{........,{{{{{,|{{..,,.((((.{.((((((.....)))))}}.}|))))),))}||,.{(((({{(.{{{,,,..{||||{||}|{|}||||,|||}}}}}||||||||.{{,,.........,,|}||||||,,|.{||},,..}},.{|||,}}},}}}})),,..,))),.)))))}....((((.(((...))).)))).,,..|,.......{((((,((((((....(((((.((((((........)))))),{{{....{{{,{(,..........,...}|,|...}}}|((.((({......)))}}}...{{{{{{........((((....)))).........,)))))).}))))...))))))|(((((....)).))),.(((((........)))))..))))).,}}}})}..,..,))))))))....)))..)}..))))
Forensic Context

No forensic context available.