Basic Information

Symbol
hsa_DSCAM_0005600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0061770 hsa_circDSCAM_009 hsa-DSCAM_0003
Host gene
DSCAM
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
21:41648024-41741172 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
21:40276097-40369245 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-635.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -664.88 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 391.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((........))(....(((((((........(((((((((...)))))))))........)))).))).........(((((.....)))))...((((((...(((((.(..(((...((....))))).).))))))))))).......((((..((((.((((((((...)))))))).))))...))))..((((...((.(((((((.......))))))).))...).))).(((((((.(.((((((.......)))))).).))......)))))((((((((((....))))))))))..((((((((.(((((((......((((..((((.(((((((..(.((((((....)))))).)..(((((.....)))))((.((((....(((((((((...)))))..(((.......))).......))))..)))).)).((((((....((((((.((((((((((((((.((((.(((((((.(((((((((...))).(((((((((....))))))).))(((.(((((...(((((...((((((.....((.(((.....(((((((((.((.......((.......))..(((((((((...((((((((.(((((......)))))((((.(....).)))).)))).))))...)))))))))..)))))))))))....((((.(((((............((((((.....)))))))).)))))))((((((...((((((.((((((...)))))).))))))..))))))(((((....)))))...(((((.((((((((.........))))((......))...((((..((.((((((((((......).))))))))).))..)))).)))))))))))).))..))))))...)))))...))))).))).(((((........)))))..((((...(((..(((((((..............)))))))...)))..))))............)))).))....))))))))))).))......((((......))))))))))))))((((((..........))))))..........))))))))))))))..((((..((...((((((((((((.....((....)).....)))))))))).))...))..)))).)))))))))))((((((...))))))((((...))))....))))...)))))...((((((((((....(((((((......)))))))...((((.(((((.......(((((.(((((((((((.((((.....(((((((.(.......).)))))))...))))...(((((((.(((((....((..(((.((((((((((.(((((((.((((((.................)))))).).)))))).).)))))..((.(((...(((.(((((....((........))))))))))..))).)).)))))))(((....))).))...))))).)))))))..((((((((((....((((((((...))))))))....))).))))))).((((..(((((.((........))..)))))(((((((.((...(((........))).)).)))))))....((.((((((....)))))).)).)))).))))))..)))))..)))))......)))))....))))(((((((((((..(((.(..((((((...........)).))))..))))..))))))))))))))))))))).(((........)))......))))))))))...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((........}}{..,,{{(((((,...,...{((((((((...)))))))))......}.))))},}}.........(((((.....)))))..,((((((...(((((.(..(((...((....))))).).))))))))))).,.....((((..((((.((((((({...}))))))).))))...))))..((({...((.(((((((.......))))))).))...).))).(((((((.(.((((((.......)))))).).))......)))))((((((((((....))))))))))..((((((((.(((((((......((({..((((.(((((((..{.{{((((,...}}}}}|.}..(((((.....)))))((.{(((,...((((,{,({.,|}}|||..{{,...,,|,,,}|,...,,}}}}..)))),),.((((((....((((((.((((((((((((,,.((({{(((((((.((((((((({..,||,(((((((((....))))))).}|,{{.{|||{,.,{((((|..||||.......,{|||||}|,.((((((((,,((.......((.......))..(((((((((...{((({((({(((((......}}}}}||||,|}}..|{|||..})))))}}}...)))))))))..)))))))))))....(((,,(((((,...........{(((((.....)))))))).)))))))((((((..,(((((((((((((...)))))),)))))}.,))))))(((((....)))))..,||((({(((..((({........||||((({{{{{.|{|.((((..((.((((((((((......),,)))))))).))..)))).|.|||||,|,((((..,||.)))}}.}))))}}...,}),)),}|||||,.......)})))}.})}}))){{{..(((((((..............)))))))...}}},|},,},,.}}.......)))).))....))))))))))),||,,,,,.,{,{,},.,}))),)))))))))){{,,,...{{{,...,)))}},..........))))))))))))))..((((..((...((((((((((((.....((....)).....)))))))))).))...))..)))).)))))))))))((((((...))))))((((...}))}....))},...)))))...((((((((((....(((((((......)))))))...((((.{((((.......(((((.(((({((((({.{(((.....(((((((.(.......}.)))))))...})))...(((((((.(((((....{{..(({{((((((((((.(((((((.((((((.{..,,,....,,..}.)))))).).)))))).).)))))..{{.{{{,..(((.(((((....((........))))))))))..))).}}.)))))))(((....))).))...))))).))))))|.,((((((((((...,((((((((...)))))))),,..))).))))))).||{{,.(((((.{(........))..))))){{((({,.{{{,,{{{,,...,,.}})})).,,,,,,,....((.((((((....)))))).)).)))}.})))))..}))))..)))))......)))),..,.))))(((((((((((..(((.(..(((({(,.......,..)).))))..))))..))))))))))))))))))))).(((........)))......))))))))))...,
Forensic Context

No forensic context available.