Basic Information

Symbol
hsa_DSCAM_0007000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0116087 hsa_circDSCAM_007 hsa-DSCAM_0042
Host gene
DSCAM
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
21:41684008-41741172 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
21:40312081-40369245 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-530.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -556.21 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 331.03
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.......))(((((((((..((((((....(((((((((...)))))))))......(((((..............(((((.....)))))...((((((...(((((.(..(((...((....))))).).)))))))))))((((((.((((..((((.((((((((...)))))))).))))...))))..((((...((.(((((((.......))))))).))...).))).(((((((.(.((((((.......)))))).).))......)))))((((((((((....))))))))))....(((...))).((((((((.((((((.((((.(((((((..(.((((((....)))))).)..(((((.....)))))((.((((....(((((((((...)))))..(((.......))).......))))..)))).)).((((((....((((((.((((((((((((((.((((.(((((((.(((((((((...))).(((((((((....))))))).))(((.(((((...(((((...((((((.....((.(((.....(((((((((.((.......((.......))..(((((((((...((((((((.(((((......)))))((((.(....).)))).)))).))))...)))))))))..)))))))))))....((((.(((((............((((((.....)))))))).)))))))((((((...((((((.((((((...)))))).))))))..))))))(((((....)))))...(((((.((((((((.........))))((......))...((((..((.((((((((((......).))))))))).))..)))).)))))))))))).))..))))))...)))))...))))).))).(((((........)))))..((((...(((..(((((((..............)))))))...)))..))))............)))).))....))))))))))).))......((((......))))))))))))))((((((..........))))))..........))))))))))))))..((((..((...((((((((((((.....((....)).....)))))))))).))...))..)))).))))))))))).((((((..((((.((((((..................)))))).)))).))))))...(((((((......))))))).......((((......)))).)))).)).))))))))))))))))))).)))))).))))))....(((......)))...(((((((.(((((....((..(((.((((((((((.(((((((.((((((.................)))))).).)))))).).)))))..((.(((...(((.(((((....((........))))))))))..))).)).)))))))(((....))).))...))))).)))))))..)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.......))((({(((((..((((((....{((((((((...)))))))))......(((({...,,.......|,(((((.....)))))...((((((...(((((.(..(((...((....))))).).))))))))))){(((((.((((..((((.((((((({...}))))))).))))...))))..((({...((.(((((((.......))))))).))...}.))).(((((((.(.((((((.......)))))).).))......)))))((((((((((....))))))))))....((,...,})}((((((((.{(((({.{{((.(((((((..{.((((((,...}}}}}|.}..(((((.....))))){{.{(((,...((((,{{({..|}}|||..{{,...,,|,,,)|,...,,)}}}..)))),),.((((((....((((((.((((((((((((,,.((({{(((((((.((((((((({..,||,(((((((((....))))))).}|,{{.{|||{,..{((((|..||||.......,{|||||}|,.((((((((,,((.......((.......))..(((((((((...{((({((({(((((,.....}}}}}||||,|}}..|{|||..})))))}}}...)))))))))..)))))))))))....(((,,(((((,...........{(((((.....)))))))).)))))))((((((..,(((((((((((((...)))))),)))))}.,))))))(((((....)))))..,||((({(((..((({........||||((({{{{{.|{|.((((..((.((((((((((......),,)))))))).))..)))).|.|||||.{,((((...,|.))))}.)))))}}...,}),)),}|||||,.......)})))}.))}}))){{{..(((((((..............)))))))...}}},|},,},,.}}.......)))).))....))))))))))),||,,,,,.,{,{,,,.,,))),)))))))))){{,,,...{{{,...,)))}}}.,,.......))))))))))))))..((((..((...((((((((((((.....((....)).....)))))))))).))...))..)))).))))))))))).((((((..((((.{(((({..................))))),.)))).))))))...(((((((......)))))))......,,{{(,,..,,,}}).})))),).)))))))))))))),}}}|,)))))).)))))}....(((......)))...(((((((.(((((....{{..(({{((((((((((.(((((((.((((((.{..,,,....,,..}.)))))).).)))))).).)))))..{{.{{{,..(((.(((((....((........))))))))))..))).}}.)))))))(((....))).}}...))))).)))))))..)))
Forensic Context

No forensic context available.