Basic Information

Symbol
hsa_DSCAM_0000400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-DSCAM_0035
Host gene
DSCAM
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
21:41414298-41551021 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
21:40042371-40179094 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-956.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1007.94 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 667.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.((((......))))))).......(((((....(((.....(((((..((((...(((((.......((.((((((((((((.((((.((((.(((.(((.......((((((.((...((((..(........)..)))).))))).))).....((((((.(((((((((((((......))..((...(((((.((((..........)).)).)))))...))(((((.((.(((((................))))))).)))))((..(((.....)))..)).......((((((.((((((((((......((.(((((...))))).))(((((((.(....((((((.((........((....)).....)).)))))).....).).))))))((((.((((((....)))))).)))).(((((.(((((...(((...............))).))))).).))))))))))))))........(((((.((....))......(((((................)))))..........(((((...)))))...(((....)))((((((((((.........)))))))..)))..)))))((((.(((((((((...........)))))......)))))))).(((((((((....((.((........)))).....)))).)))))))))))((((((((((.(((.((......((((.((.(((((......))))))).))))...((((((.......))))))))))))).))))))))...(((((((((((((((((((((.((((((((((((((......((..(((..((..(((((((((((..((((((((((((((((....(((............)))...((((((((.(((....)))..))))))))......)))))).((((..((((((((((.(((((((...(((.....(.((((((((...(((...(((......))).......((((.....)))))))..)))))))).)....))).))).)))).)))))...)))))))))))))))..))))...))))))........((((((((.......((((((.(((((....))))).))))))...(((((((..(((.((.((.((((.....)))).)).))..((((((((.(((((((......((((..((((..((((....(((((...)))))....))))..))))))))..(((.((((((((((((........(((((((((.((.((((....................)))).)).))))))(((....)))..........(((((...))))).........)))....))))).(((((.......)))))(((((((((((((..(.....((((((..((((...........)))).)))))).((((.(((((((.........(((((.........))))))))))))))))..(((((((((((((.....(((((.((((....((((((.......(((((..((((((.(..(((....)))..).)).............(((.(((.((.(((((....))))).)).))).)))(((..(((((...(((..((.((((((.....))))))))..)))..)))))..))).))))......(((..........)))....)))))))))))....)))).)))))........(((((.....))))))))))))))))))((((((.....))))))....)..)))))).))))))).))))))).)))(((....)))((.((((........)))).))......((((((........)).)))).......))))))).)))))))))))..))))))).......((.(((((((((...(((..(..((((....(((((.(((.....((((((((((((((((.((((((((((..((((.(((((((((((.((.(.....).)).))))))))))).))))....((((.(((((((((......(((((((((.....(((..((((.((.....(((..(..((((..(((....(((.(((.(((.(((((((.(.(((........))).).))))).)).))).))).)))....(((.((((((((((...)))))).)).)).))).)))..))))..).)))...)).))))..)))...)))))))))....(((...)))((((........(((((((((((....))))...(((....)))((((...((((..((...))..)))).))))((((.....)))).((....)).((....))..((((((...((.((((......)))).)))))))).))))))).......)))).........)))))).))).....))))....))).)..)))))).)))....)))))).)))))))))).))).))....))))..).)))....))))))))).)))))))))).((((((.((........)).)))))).........)))))...))..)))..))......)))))))))..)))))...))))...))).)).))...)))))).))))......))))))).))))))))))..........))))))))))...)))).(((.((((......(((....((((...))))..)))......)))).)))....((((...(((((.....)))))..))))..........))).))))))))).)))))))...)))))))))...))).)))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((,{((((.,,,,.}}}}})),..,...(((({....({{..{..(((((..((((...(((((,......{(.((((((((((((.,.({.((((,{((,{,((({{...,,,..}}||}..((({,.(,.......}..)))).}},,,,}}),}||.((((({,(((((((((((,,.,.,{,||...,...|||(({((((...,,.,.,..|{,|.}},})||,.{|{(({,||,{((({.....,..........))}}},,.}))}||{..{((.....)))..}},.,.,,.((((((.((((((((((......{(.((((,...|)))).}}(((((((,{..,{{(((((.({....,,..{{....)),}...}}.})))))..},.}.},})))))((((.((((((....)))))).)))).(((({.{((((,,.(({...............))).))))).).))))))))))))))........(((({.({....)}......,{{{{...............{|||||.......,{.(((((...))))),,||||....})))||(((((((,,....,,.)))))))..,},..)))))((((.(((((((({,.,........)))))......)))))))).(((((((((....((.((........)))).....)))).)))))))))))((((((((((,(((.(({{{{..((((.((.(((({......})))))).))))...,,(((,..,}}..)))))))}))))).)))))))),,,(((((((((((((((((((((.((((((((((((((....,.{{..,{(,{,,..(((,(((((((..((((((((((((((((....{{{............}}),..((((((((.(((....)))..))))))))......)))))).((((..((((((((((.(((((((...(((.....(.((((((((,,..{{,,.{{{....,.)))..,.{{.((((.....)))).}}..)))))))).)....))).))).)))).)))))...}))))))))))))))..))))...))))))).......{(((((((.......((((((.(((({....})))).))))))..{((((.({{((((.((...(((((.((((((...,,.....,|,.,.(((((.(.(((.....((((..((((..((((....(((((...)))))....))))..)))))))).....))).).)))))..,..,.))))))((((((.((.({{{,,{{...,,,...,}}}...}))).)).))))))(((....)))....)))}),...))...)))))).))))}((,((((({(({(({(((({,......)})))}|||||,,.,,,|,{|{{{{...,,,,.)}}.}},..((((((({{(((,.{(((((((((((..,,,.(((((...((((({.,{(((........)))}........{((((((((((((.....(((({.{(((...,((((,,......|||||(,,((((((.,..(((....)))..,.}}.....,|...||.(((.(((.((.(((((....))))).)).))).))){||..({{{{...(((..{{.((((((.....))))))}}}.))}..|||||,.||}.,)))},}},..|}},,,.....,|||...,||}||||||||.,..}}}}.)))}).....,,,|||||.,,,,})))}))))))))))))}(((((({...{|||||,..(((..,,))).,...)))))}))))))),|{((....,}))((.((((........)))).)).,}})))))..))))),,{.,..,}}.}},..})))))))))))},))}.....)))))))....,,)))))))).)),.......,((((((((...(((((({,((((..((((((((((((((((({{((({{{((,{((((((,(((((((((((.((.(....,|,}}.))))))))))}.}|||,..,..}}}{||||||||,.....(((((((((.....(((..((((.{(..,..(((..(..((((..(((....(({.(((.(((.(((((((.(.(((,.....,.))).).))))).)).))).))).}))..{,({(,((((((((((...)))))).)).)).))),)))..))))..}.))).,,)}.})))..)))...)))))))))....{{{...)})((((........((((((({,||...,||||,|.|,{,.,,)))((((...((((..((...))..)))).))))((((.....)))).{{....}}.((....}}..((((((...{{.((((......)))).}))))))),))))))).......))))...}}}},}),}}}}.}}},..}}}||},.},}}},|,}},}}},}}}..},.}})))).)))))))||.,..........,,..}}..))))))))))))))))))))))))))}.((((((.((........)).)))))).......,,|||,,...,,}})))..}}.}....)))))))))..)))))...))))...)))},).)}..,)))))).))))..,,..))))))).))))))))))..........|||||}|}}},,.),}},|((.((((......(((....((({...})))..))).,....)))).)))....((((...(((((.....)))))..))))..........))).))))))))).)))))))...)))))))))...,)),))))).,...,
Forensic Context

No forensic context available.