Basic Information

Symbol
hsa_DSCAM_0002200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-DSCAM_0070
Host gene
DSCAM
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
21:41465648-41516658 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
21:40093721-40144731 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-266.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -282.03 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 174.27
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.