Basic Information
Symbol
hsa_DSCAM_0003200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-DSCAM_0033
Host gene
DSCAM
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
21:41505781-41550930
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
21:40133854-40179003
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-212.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-226.37 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
130.37
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(....)(((.(..(((((........)))))..((((..(........)..)))).((.((.((((((..((((((((((((((.((....))))))).))))..(((((.((((..........)).)).))))).....(((((.((.(((((................))))))).)))))((..(((.....)))..)).......((((((.((((((((((......((.(((((...))))).))(((((((.(....((((((.((........((....)).....)).)))))).....).).))))))((((.((((((....)))))).)))).(((((.(((((...(((...............))).))))).).))))))))))))))........(((((.((....))......(((((................)))))..........(((((...)))))...(((....)))((((((((((.........)))))))..)))..)))))((((.(((((((((...........)))))......)))))))).(((((((((....((.((........)))).....)))).)))))))))))))).))..)))).).)..)).))((((.((.(((((......))))))).)))).....).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(....)(((.{..(((((........)))))..({({,,(,.......,..)))).((.((.,{((((..((((({((((((((.((....)))))))},))}..{((((,((((..........,}.}}.}}}))|,..{{{{((,|{,(((((................))))),}.)))}}|{..(((.....)))..)},...,,.((((((.((((((((((......{(.(((({...})))).)}(((((((.(..,{{(((((.({..,.....{{....}),|...}}.))))))..},.).),})))))((((.((((((....)))))).)))).(((((.{((((,,.(({...............))).))))).).))))))))))))))........(((((.((....))......,,,,{...............{|||||.......,{.(((((...))))),,||||....,)))||(((((((,,....,}.)))))))..,,...)))))((((.(((((((((,.,........)))))......)))))))).(((((((((....((.((........)))).....)))).)))))))))))))))))..)))).,..,,},.))((((.((.(((({......})))))).)))).....).)))
Forensic Context
No forensic context available.