Basic Information

Symbol
hsa_chr21_0086300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-DSCAM_0112
Host gene
DSCAM
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
21:41511383-41511865 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
21:40139456-40139938 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-107.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -119.46 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 130.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.(....).))))))).(....((.(.((....(((((......(((((.....((((((((((((((....((..((((.((((((.(..(........)..))))))).))))..)).((((((((..(.(((.......))).)..))))))))......(((((...(((((((((.(((((((.(.(((..((((((((....(.((.((((((((((((((...)))))))))))))).)).)..))))))))))).)...))))))).)))))))))...)))))((.(.((((((..(((((((.(.(((((.........(.(((((((...))))))).).......(((((.((((((((......)))))))).)))))............))))).).))))))).)))))).).))...))))))).)))))))))))).....)))))....))).))..).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((.(....).))))))).(...,((.{,({,,,,(((({....,.((((({,.,(((((((((((((((....((..((((.(((({{{{..{........}..})))))).))))..)).....{({,|.,.((..{((((((...{,.,{{.(.((((....(((((...(((((((((.({(((({.(.(((..((((((((....{.{(.(((((((,,(((((...}))))}}))))))).)).,..))))))))))).)...}))))}).)))))))))...)))))...)))).).}}}},,.))))))).}}.,...}}}..,.((((({{...|||||||,,,.......,,,{.{{{(({{{......)))))))).},|||.{.{.{{{{,{,{(({,....}}}},,})))).).}.))}..))))))).))))))))))))}....)}}))..,,.,},))..).
Forensic Context

No forensic context available.