Basic Information
Symbol
hsa_DSCAM_0004400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-DSCAM_0129
Host gene
DSCAM
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
21:41539145-41711342
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
21:40167218-40339415
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-587.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-619.44 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
558.11
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((((((.......(((((((....((((...((((((((((((.((((((...((((((.((((((...)))))).))))))..))))))(((((....)))))..(((((((.(((((((.........))((((......)))).((((..((.((((((((((......).))))))))).))..))))............(((......)))((((((((.....(((((((...(((((..((.((((((((((((((((((..(((((((..............)))))))....((((.....))))..................))))))))..........)))).)))))).))..))))).....((((((..........))))))..((((((.....(((((((((((..((((..((...((((((((((((.....((....)).....)))))))))).))...))..))))..)))))))))))((((((..((((.((((((..................)))))).)))).))))))...(((((((......)))))))..........))))))((((.........))))))))))).......))))))))))))).))).))))))))))).)))))....))))..)))))))((((((....)).)))).)))))).(((((((((((((...............(((.((((((((((((((((...)))).)))((....))..((((((..((.(((((((...(((........))).((((((.(((....))).))).......((((((((((((((((....((((((((...))))))))....))).))))))).)))))).(((((((((.((.....((((((...((((........))))..(((((((.((((..........((.((((((....)))))).)).(((.(((((......(((......)))........))))).)))(((((((((((..(((.(..((((((...........)).))))..))))..)))))))))))((((((((((........))..))))))))(((....))).....)))))))))))......................(((((......)))))))))))....))))))).))))..)))))).)))).))..))))))...(((((((((((((((((..((((((((.........(((((.(((.....((((.(.((((((.....))))))).))))))).)))))..((((((((..........)))).))))..))))).))))))))))))(((..((((...........(.((((((....(((.........((((.........))))..)))...)))))).)..((((.(((...))).)))))))).))).......(((((((((((....(((((.((((((........))))))((((....((((((.........))))..)).....))))((.((((......))))))...((((((........((((....))))..........)))))).)))))...)))))))(((((....)).)))..(((((........)))))..))))((((.(......).)))).......)))))))))))).))))).))))))).))))))))).......(((((.((((..........)).)).))))).)).))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((((..........,{,((((((((.....))))))||,||,|,,.((((((..,(((((((((((((...)))))),)))))}.,)))))),((((.{{{|||||(({(((({{{{{.,(((,........||||(({{{{{{,|{{.((((..((.((((((((((......),})))))))).))..)))).,.|{{{{.{,((((..,...}})}|{|||||},...,{|{||,}|||||,....,..||}|||,|{{({{{(((..(((((((..............)))))))....,,,,,,.....|||......,,..,{{,,..|||}||||({{.........||.})))).})),}})}}}}..,,{{,,,,..,,,....,)))}}}..,..,,,.....{((((((((((..((((..((...{{((((((((((.....((....)).....)))))))))).}}...))..))))..))))))))))|(((((,..||||}|((((...,}},..,,,,.,,..,,})))}.),))}))))))}.}}||,,||}}}}}.|||||||...{(((,.,(({,{{(..{{{{.,,,,..{||||,||||{{...{,|||}||||,,,((((({...{((,.....))),,,..}}))))..|))))..||}}||}},|}}..||||,||||{((((((((((((((,,........,....|||.(((((((({(((((({...}))).)))((....))..((((((..{{.{{{(({(,,,(({{{,...,.))),|{{(((,{{{,,,.}}}.,}},.,....{(((((((((((((((...,((((((((...)))))))),,..))).))))))).)))))}.((((((((,,((..,,.((((((...((({..{,,,,,||||..((({{{|.{({{..........((.((((((....)))))).)).((({.((,.....},)))).||||{,,.|||,.,,}}..)))|((((((((((((..(((.(..(((({(,..,....,..)).))))..))))..))))))))))))}(((((,((,{{{....,,..))),,))).||.}}}||,.....,})),}}||||....,,,,..............(((((......)))))))))))....))))))},))))..)))))).)))).}}..)))))}...((((((((((((((((,{({{{({{((........,((({(|({{..,,,((((,{,((((((.....|||||||,||||||},}}}||{.((((((((.,.......,)))),)))),}))}}}.}}))))))))))|||}.{{{{...........{.((((((..{.{((.....,,..(({{.....,,..))}}..)))}..)))))).,..((((.(((...))).))))}}},.||........|||{.||||||,,,.|||||.((((((........)))))}{{{{....{{{,{{,..........,...}|,|...}}}|((.((({.,...,))}}}}...{{{|,|,,.....,||{|,...))))...,..,..}))},)),,})))},.)))}}}|(((((....)).)))}.(((((........)))))..||||((((.{......}.)))).......)))))))))))).))))).})))))),,))))))))..}}}}.|||||.}|||,....}}}}.,)})}.)))))))...)))))))
Forensic Context
No forensic context available.