Basic Information

Symbol
hsa_DSCAM_0006200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-DSCAM_0047
Host gene
DSCAM
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
21:41648079-41741172 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
21:40276152-40369245 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-611.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -643.01 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 453.26
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...(((.....((.((.(.(((((((.(((.(((((((((...)))))))))...(((..((((((...........(((((.....)))))...((((((...(((((.(..(((...((....))))).).)))))))))))((((((.((((..((((.((((((((...)))))))).))))...))))..((((...((.(((((((.......))))))).))...).))).(((((((.(.((((((.......)))))).).))......)))))((((((((((....))))))))))....(((...))).((((((((.((((((.((((.(((((((..(.((((((....)))))).)..(((((.....)))))((.((((....(((((((((...)))))..(((.......))).......))))..)))).)).((((((....((((((.((((((((((((((.((((.(((((((.(((((((((...))).(((((((((....))))))).))(((.(((((...(((((...((((((.....((.(((.....(((((((((.((.......((.......))..(((((((((...((((((((.(((((......)))))((((.(....).)))).)))).))))...)))))))))..)))))))))))....((((.(((((............((((((.....)))))))).)))))))((((((...((((((.((((((...)))))).))))))..))))))(((((....)))))...(((((.((((((((.........))))((......))...((((..((.((((((((((......).))))))))).))..)))).)))))))))))).))..))))))...)))))...))))).))).(((((........)))))..((((...(((..(((((((..............)))))))...)))..))))............)))).))....))))))))))).))......((((......))))))))))))))((((((..........))))))..........))))))))))))))..((((..((...((((((((((((.....((....)).....)))))))))).))...))..)))).))))))))))).((((((..((((.((((((..................)))))).)))).))))))...(((((((......))))))).......((((......)))).)))).)).))))))))))))))...(((((((.(.......).))))))).....(((.((((((((.(((((....((..(((.((((((((((.(((((((.((((((.................)))))).).)))))).).)))))..((.(((...(((.(((((....((........))))))))))..))).)).)))))))(((....))).))...))))).)).((((((((((((((((....((((((((...))))))))....))).))))))).))))))(((((.((........))..)))))..((((........))))...)))))))))............((.((((((....)))))).)).((((.((......))))))..))))))..)))(((((((((...)))))))))....)).).)))))))))).))......)))...)((.....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({....,...}|(,.{{.{.(((((((.(((.(((((((((...)))))))))...(((..(((((({{,....,.,.(((((.....)))))...((((((...(((((.(..(((...((....))))).}.)))))))))))((((((.((((..((((.((((((({...}))))))).))))...))))..((({...((.(((((((.......))))))).))...).))).(((((((.(.((((((.......)))))).).))......)))))((((((((((....))))))))))....(({...,})|((((((((.{(((({.{{((.(((((((..{.((((((,...}}}}}},}..(((((.....))))){{.{(((,...((((,{{({..|}}|||..{{,...,,|,,}}|,...,,)}}}..)))),),.((((((....((((((.((((((((((({,,.((({{(((((((.((((((((({..,||,(((((((((....))))))).}|,{{.{|||{,.,{((((|..||||.......,{|||||}|,.((((((((,,((.......((.......))..(((((((((...{((({((({(((((......}}}}}||||,|}}..|{|||..})))))}}}...)))))))))..)))))))))))....(((,,(((((,...........((((((.....)))))))).)))))))((((((..,(((((((((((((...)))))),)))))}.,))))))(((((....)))))..,||((({(((..((({........||||(({{{{{{.|{|.((((..((.((((((((((......),,)))))))).))..)))).|.|||||,|,((((..,,,.)))}}.}))))},...,}),)),}|||||,.......)})))}.}}}}))){{{..(((((((..............)))))))...}}},|},,},,.}}.......)))).))....))))))))))),||,,,,,.,{,{,}}.,}))),)))))))))){{,,,...{{{,...,)))}},..,.......))))))))))))))..((((..((...((((((((((((.....((....)).....)))))))))).))...))..)))).))))))))))).((((((..((((.{(((({..................))))),.)))).))))))...(((((((......))))))).......,{{(,,..,,,}}).})))},).))))))))))))))..,((({(((,{..,,,{,|.}}|||}}....}}|,.,{{|||||,{{{||,,..||,|((,{(((({(((((.(((((((.((((((.{..,,,....,,..}.)))))).).)))))).).))))}..{{.{{{,..(((.(((((....((........))))))))))..))).}}.))))))){{{.||{,}}.}},..))}}),}},|{((((((((((((((...,((((((((...)))))))),,..))).))))))).)))))}{|{{|}||,,.,....}),,))))){,((({.,{{{{{{||||.{,{|,}}}}))......,,....((.((((((....)))))).)).((({.((,.....}})))).,})))))..)))(((((((((...)))))))))....)).).)))))))}),.|,{{{.{{......)),)}),.,)
Forensic Context

No forensic context available.