Basic Information

Symbol
hsa_EIF3J_0002300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0103628 hsa_circEIF3J_005 hsa-SPG11_0108
Host gene
EIF3J
Type of circRNA
Exon-Intergenic
Location (GRCh37)
15:44852447-44855423 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:44560249-44563225 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-533.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -580.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 775.24
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((..(((.(((.((.....)).))).)))))))(((.((.((((((((.......................)))))))).))......((((((((((..(((((((.(((((((((((.((((((((((.(((((((((((...(((((((...(((.((....((.(((((((((((.((((...(((((((.......(((((((............))))))))))))))((((....))))..)))).)))))).......))))).))))..)))..)))))))..(((.((........))))).))))))))))).))))).))))))))))).....))))).)))....(((...(((((((((((((..(((((((((((((((((....((((....))))(((((((..((((((((((.........(((((((....)))))))))))..))))))..))))))).(((((....(((.(..(....)..).))).)))))........(((((((((..((((.....(((((.((((((((((.(((.......(((.(((((.(.............)))))).((((((((((...((.(((((((.....)))).))).))....))))))))))((((((.....(((...(((((((((((..(((((((.((....((((((((((....((((((.(((.((((..(((....)))..((((((......))))))(((((.((((((((((....(((((....)))))..((((((...(((((((.(((((((....(((....)))......))))))).((((....))))..(((((((..........)))))))(((...(((((((((.((((........))))..)))))))))....)))(((((((((((((....))))).))))))))...)))))))....)))))))))))))))))))))...........(((((((((((((((..(.(((((((.............))))))).)....(((((((........)))))))...)).)))))))))))))((...(((((((.....((((....))))....)))))))...))....(((((((((((((((((...))))))).........))))))))))..))))..))).))))))......(((((......((((((((((.((((((.((((((.((((((((.(((((...))))))))))))).......))))))..((((...((((..((........((((.(((.(((((.....(((((........)))))......))))).))).))))........))..))))...))))..))))))(((((((.....))))))).....)))))))))))))))((((((.(........)..))))))))))))))))...)))))))))..)))))))))))...)))...))))))....((((((.....))))))..((((((........))))))...))).......)))..))))))...)))).)))))...........(((((....))))).................))))..)))))))))...(((((......)))))......))))))))...))))).))))..))))).)))))))))))..((((((((......(((...(((((.....)))))...)))...(((((.((((........)))).)).)))((((((.(((....(((....)))..........((((........)))).....))).)))))).........))))))))(((((..(((((((.(((.(.((((((((.(((((((((((((((((((.......)).)))....((((((((..(((((((....)))))))........))))))))..(((((......)))))))))))))))).))).)).........((.....))((((........))))..)))))).)))).)))))))....)))))...)))).))))))))))........((((.((......)).))))((((((...((.(((((.((((((((.........((((.....(.(((((((((((....))))))))))).).......))))........))))))))......))))).)).......))))))...)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((,.,(((.(((.((.....}).))).)))))))(((.,(,{(((((((..{......,.............})),,))),))},,...((((((((({.{((((((({,{(((((((((,,,,..{(((({(((({.,,,({.,,{,,||{{}}}|||}||}}..{,,(((((((((((.{{{(,,.((((({,..,,,,|(((((((............))))))))}}}}}}|||{...,}}||,,)}}}.}}}}||,.,,...}}}}}||}|}||}}}|.||||||,..{(({,{..,,,,..||{({{{{{|||,,|||{||{|,.{(((((((((((.({,,{({{{,({{,.,{,|...,,,|,|,||||||.,}}||,}}.))))))))))},.,,{{.,,,)},,(((((((..((((((((((.........(((((((....}))))}})))},.})))))..))))))).(({{(....{((.{,.|....}})).))}.)))}}........|,||,,.||..,,}))))))),{,,..{,.,,,{{{,{{{,..,{{{|||.,,{({,,..,,||,,....,||||||,((((((((((...((.(((((((.....)))).))).))....)))))))))).||||......||,,,,||||,|,,,,......,,,||||...||{.||{{,|{|||||,}}})}}))))}}))}|||,...}})|,(({(((......}}}}}}{((((.((((((((((.,..(((((..,.}}}}}..(({{{{..,{(((({,.{((((({.,..,,{,,|,,.......,)})))),.{{{{....|||}.{(((((((..........)))))))}.,}}}|||||{|{{||||||.....,.})))}.})}})))))....}}}(((((((((((((....))))).)))))))),||}}))))}....}})}))|))))))))))))}|,,,....,,,.(((((((((((((((..,,(({((((....,,....,,.}}}}))),|.{{{((((({{.||,,...},))))}...))}})))))))))))).,..,{{{{{,...|||{{{{{...||((((,{||,..,.,,{{{,...(((((((((((((((({...})))))).........))))))))))})}}||,,|,,|,||||||,,.....,,,...,..{,(((((({,.,||||.,||{{||.{(((((((.((((,...,)))))))))))},,.....}})))},,}.,|||{{|{{||||||.|{((({,,{.,,...,|||||...{{{{{.||{{.{{||.,......,,)))).))}},)))}}..,,,,,}||||||.|||||||,}}|||{(((((((.....))))))}}..|{||},,)))))}},,,((((((,(........}..}})}}}.,}}))}}}|,,|||}}},.})))))},|||{{{{{{..||,..,{{||.,|||||||||.....}))))}...|||,}}}}}...})))))},,.))))).)),,,))}}))}||,.|||{{...}|}}...,,.,,.}},||||...,}}))}|},,.|},}},.,...,}}}}}}.,}|}||}}}..{{{{{......}}}}}..|||{|,,,,))}||,}}}}}||}}||((((((.....)))))).{{({{{{,,,......{{{.,.,{{{,.....}})))}},)}}...(((((.((((........))}}.}}.})){{||{|,|||,,,,|||,,......,..,,..,,{{{|..,.....)}}},,|,,}}}.})))))..,,,,.,,))))}}||{((((..(((((((.({{{(.((((((((.(((((((((((((({({,{.......}}.}}},,,.((((((((,.(((((((....)))))))....,,..)))))))).,||(({......))}),))))))))))).))).)).,.......{,.....))((((........))))..)))))).)))).)))))))....)))))))}.))),))))))))))........((((,{{...,,,}|.}))){{{{((...,(,{{{{{.((((((((.....,,..((((.,...{.(((((((((((....))))))))))).}...,...))))..}}....))))))))......))))).,}.},....))))))...)))
Forensic Context

No forensic context available.